单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的飞速发展使人们对组织中细胞种类、细胞的特殊状态有了深入认识。但是,scRNA-seq对于器官或者固体组织制备的细胞悬液的细胞活性和细胞数目有着较高的要求,这也意味着 “躺在”超低温冰箱中的大量珍贵临床样本(脑组织,肿瘤组织等)都无法进行scRNA测序。而单细胞核RNA测序技术(snRNA-seq)的出现,则在很大程度上解决了以上问题。
生命科学研究技术在不断发展和进步,生物学的研究层面也在不断拓展,从组织到细胞再到细胞的空间分布定位,生命科学的研究正在进行从二维到三维的巨变。空间转录组是这一转变的引领者之一。
人类细胞图谱计划,旨在绘制人体的每一种细胞类型。人类心脏图谱的相关数据公布在国际尖端期刊《Nature》上。该研究利用10x Genomics技术,对健康人心脏的近50万个单细胞进行了测序分析,构建了迄今为止较为广泛的人类心脏细胞图谱。
肠道生态环境的改变与人类健康与疾病显著相关。肠道代谢物,包括氨基酸和细菌代谢物(eg. 胆汁酸和短链脂肪酸)与肠癌状态有关。因此,通过宏基因组和代谢组分析可以为了解肠道环境的变化与CRC的发展提供方法。
转眼9月已经过去,小编在这里为大家精心上收集了以DNA甲基化研究为主题的新研究成果,截止现在,9月以DNA methylation为关键词检索到的文献一共有603篇,小编在这里为大家精心挑选了以下6篇作为重点分享。
现在很多的研究同时进行Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq,为了明确单细胞测序分析结果的准确性,可以利用相同样本的 Bulk RNA-Seq 数据进行评估,两种测序结果相互印证。
九月份单细胞测序相关文献共收集到48篇(IF>9),文末列表中列出文献发表期刊、研究方向和技术平台等信息,接下来先看看其中6篇。
组织样本制备细胞核悬液流程适用于人或其他哺乳动物新鲜及冻存组织样本。通过裂解细胞膜,释放细胞核的同时保持细胞核膜的稳定。优化的细胞核重悬液能够有效维持细胞核膜的完整和染色质的空间结构稳定。