现在很多的研究同时进行Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq，为了明确单细胞测序分析结果的准确性，可以利用相同样本的 Bulk RNA-Seq 数据进行评估，两种测序结果相互印证。
九月份单细胞测序相关文献共收集到48篇（IF>9），文末列表中列出文献发表期刊、研究方向和技术平台等信息，接下来先看看其中6篇。
组织样本制备细胞核悬液流程适用于人或其他哺乳动物新鲜及冻存组织样本。通过裂解细胞膜，释放细胞核的同时保持细胞核膜的稳定。优化的细胞核重悬液能够有效维持细胞核膜的完整和染色质的空间结构稳定。
伯豪生物邓老师给大家介绍一下对转录组TCGA & GEO的数据进行分析，包括差异分析、富集分析、单基因展示以及其它个性化做图。
在深层皮肤损伤后，哺乳动物的进化为了加速伤口愈合，会产生纤维化疤痕。我们无法再生功能性真皮以及一些功能附属物是人类皮肤伤口愈合的主要障碍。有趣的是，一些组织拥有再生的能力，例如全层切除皮肤伤口后的新生毛囊(HF)形成已经在小鼠中被证明，这作为一个强大的模型，以了解潜在的皮肤再生机制。哺乳动物的新皮肤修复纤维化瘢痕的形成是由于真皮成纤维细胞占优势，容易产生过量的纤维胞外基质。因此，确定成纤维细胞的来源对于改善伤口愈合效果的治疗至关重要。
结直肠癌（CRC）是常见的恶性肿瘤之一，在我国的发病率位于恶性肿瘤第3位、死亡率排第5位，其发生被遗传和环境因素共同驱动。目前，结直肠癌的主要治疗方法为外科手术治疗、辅助放化疗，但晚期CRC患者的总体生存率仍然很低。因此，寻找经济有效的诊断及预后评估指标，为CRC患者提供有效的术后监测以及提高治愈率尤其关键。
项目新文|基于GEO、TCGA数据库研究MARC2抑制肝细胞癌进展的机制：“新型线粒体酰胺肟还原成分2是癌症的有利指标，通过调节p27的表达来抑制肝细胞癌的进展”文献伯豪生物客户解读。
前面我们有介绍了利用10x Space Ranger软件分析空间转录组原始数据得到可用于下游分析的矩阵和镜像文件。今天来介绍一下怎么利用Space Ranger的结果文件进行后续分析，这里主要使用Seurat在进行下游分析。
前期软文我们整理了单细胞核测序（snRNA-seq）相对于单细胞测序（scRNA-seq）的一些优势，包括细胞类型多样性，酶解偏好性，样本类型（冰冻或者新鲜样本），酶解产生的应激性等方面。涉及的组织主要集中在脑，肾脏和心脏。其实，snRNA测序还有其他的优势，比如可以更好的研究基质内嵌的间充质细胞；减少线粒体相关基因，管家基因的检测；以及可以识别更多的lncRNAs。
