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microRNA 与靶基因网络图

Demo 结果

图中显示了 microRNA 与 mRNA 之间的关系

结果解读

结果中显示了 microRNA 与 mRNA 之间的关系,图中 microRNA 调控的靶基因越多,说明 microRNA 影响了这一群靶基因的功能;靶基因被多个 microRNA 调控,说明该基因为核心的基因。


microRNA 与靶基因网络图介绍

将显著性功能与显著性 Pathway 所包 含的靶基因取交集后与 microRNA 构建 microRNA 靶基因调控网络,可以在全局的水平上直观的反应基因之间的相互关系,同时反映了基因调控网络的稳定性。根据网络中 microRNA 的位置函数计算出 microRNA 在网络中的关系强度,即 microRNA 的网络特征值。特征值高 microRNA 处于网络的枢纽性地位,该 microRNA 调控能力强,对网络结构和样本性状有重要的调控价值,同时从网络中也可以得到被 microRNA 调控的关键靶基因。

分析要求

microRNA 进行靶基因预测并且对靶基因进行筛选后。

提供结果

1、图片文件(Network 图),包括 png,PDF 格式;

2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打开进行细节调整;

3、文本文件:microRNA 与靶基因的关系,microRNA 与靶基因的核心基因筛选。

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