伯豪生物邓老师给大家介绍一下对转录组TCGA & GEO的数据进行分析，包括差异分析、富集分析、单基因展示以及其它个性化做图。
在深层皮肤损伤后，哺乳动物的进化为了加速伤口愈合，会产生纤维化疤痕。我们无法再生功能性真皮以及一些功能附属物是人类皮肤伤口愈合的主要障碍。有趣的是，一些组织拥有再生的能力，例如全层切除皮肤伤口后的新生毛囊(HF)形成已经在小鼠中被证明，这作为一个强大的模型，以了解潜在的皮肤再生机制。哺乳动物的新皮肤修复纤维化瘢痕的形成是由于真皮成纤维细胞占优势，容易产生过量的纤维胞外基质。因此，确定成纤维细胞的来源对于改善伤口愈合效果的治疗至关重要。
结直肠癌（CRC）是常见的恶性肿瘤之一，在我国的发病率位于恶性肿瘤第3位、死亡率排第5位，其发生被遗传和环境因素共同驱动。目前，结直肠癌的主要治疗方法为外科手术治疗、辅助放化疗，但晚期CRC患者的总体生存率仍然很低。因此，寻找经济有效的诊断及预后评估指标，为CRC患者提供有效的术后监测以及提高治愈率尤其关键。
项目新文|基于GEO、TCGA数据库研究MARC2抑制肝细胞癌进展的机制：“新型线粒体酰胺肟还原成分2是癌症的有利指标，通过调节p27的表达来抑制肝细胞癌的进展”文献伯豪生物客户解读。
前面我们有介绍了利用10x Space Ranger软件分析空间转录组原始数据得到可用于下游分析的矩阵和镜像文件。今天来介绍一下怎么利用Space Ranger的结果文件进行后续分析，这里主要使用Seurat在进行下游分析。
前期软文我们整理了单细胞核测序（snRNA-seq）相对于单细胞测序（scRNA-seq）的一些优势，包括细胞类型多样性，酶解偏好性，样本类型（冰冻或者新鲜样本），酶解产生的应激性等方面。涉及的组织主要集中在脑，肾脏和心脏。其实，snRNA测序还有其他的优势，比如可以更好的研究基质内嵌的间充质细胞；减少线粒体相关基因，管家基因的检测；以及可以识别更多的lncRNAs。
10x空间转录组数据跑完Space Ranger之后都会生成单个样本的cloupe.cloupe文件，这个文件可以用Loupe Browser来对单个样本进行可视化，Loupe Browser操作简单、结果直观，非常适合不太会写代码的老师或同学来自己挖掘数据。
本期的主题是胃肠道肿瘤，为大家搜集了RNA m6A修饰的相关研究，样本类型有全血、细胞和组织。其中全血样本的研究主要为了寻找标志物，而细胞和组织通常会结合出现，以便进行深入的机制研究。
伯豪生物通过互联网收集到8月单细胞测序相关文献41篇（平均IF>9），于本文末列出单细胞测序文献发表期刊、研究方向和技术平台等信息，伯豪生物随机挑选了其中5篇，供大家查阅，以期望提供更多单细胞测序科研思路给科研领域内的各位科研工作者。
