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作为非编码 RNA 研究领域的三大明星分子

lncRNA、circRNA、miRNA

lncRNA 的研究热度一直持续升温

lncRNA 数量庞大，类型多样，作用模式丰富。那么我们一般都是如何进行疾病相关的 lncRNA 分析的呢？常规的分析一般都是从 lncRNA 的作用模式着手。

lncRNA 的作用模式主要分为三大类：

1. lncRNA 通过 cis 或 trans 靶基因行使一定的功能；
2. lncRNA 通过与蛋白质结合行使功能；
3. lncRNA 通过 ceRNA 调控机制行使功能。

目前疾病相关的 lncRNA 研究中 ceRNA 调控机制研究必是 No 1。那么既然大家都选择从 ceRNA 调控机制研究，势必会出现扎堆研究现象，这种套路研究相对简单，但是难以避免的发不了太高分的文章，那么对于这种情况我们该这么解决呢？下面的这篇文章很好的展示了 2020 年如何在套路研究的基础上发高分文章。

该文章是 2020 年 1 月南京医科大学附属第一医院的研究团队发表在 Molecular Cancer（IF=10.68）杂志上的，文章标题为“TEAD4 modulated LncRNA MNX1-AS1 contributes to gastric cancer progression partly through suppressing BTG2 and activating BCL2”。文章研究发现受转录因子 TEAD4 表达调控的 lncRNA MNX1-AS1 可以通过抑制靶基因 BTG2 的表达来参与调控胃癌进展，同时 MNX1-AS1 可以通过 ceRNA 调控机制激活 BCL2 的表达来参与调控胃癌进展。区别于常规的在一篇文章里只进行一种 lncRNA 作用模式研究，该文同时进行了两种，而且数据分析透彻，实验内容充足，小伙伴们可以学习起来哦。

胃癌（Gastric cancer, GC) 是癌症相关死亡的第三大病种，也是全球第五大常被诊断的癌症。由于缺乏敏感和特异性的生物标志物，大多数患者在胃癌晚期才被确诊。因此，迫切需要进一步研究胃癌的发病机制，识别与胃癌相关的有效生物标志物。

长链非编码 RNA (long non-coding RNA, lncRNA) 是长度大于 200 个核苷酸的转录本。有研究报道，lncRNA 通过参与调控细胞凋亡、细胞分化和转移等多种生物学活动，从而影响癌症的进展。此外，lncRNA 通过与细胞分子如蛋白质、RNA、DNA 等的相互作用，调控关键基因的异位表达。因此，将 lncRNA 作为胃癌发生相关的潜在分子进行研究，未尝不是一个很好的选择。lncRNA MNX1-AS1（又称为 CCAT5）初被认为是在结直肠癌（CRC) 中高表达的基因。有研究报道称 CCAT5 通过与 STAT3 相互作用促进 CRC 的进展。另一研究报道称，E2F1 可激活 CRC 细胞中 MNX1-AS1 的过表达，而 MNX1-AS1 通过海绵吸附 miR-218-5p 增加 SEC61A1 的表达，从而促进 CRC 发生。此外，MNX1-AS1 高表达组 CRC 患者的预后明显差于 MNX1-AS1 低表达组，显示了 MNX1-AS1 对 CRC 的预后具有一定的参考意义。越来越多的证据也表明 MNX1-AS1 过表达存在于多种癌症中，包括胶质母细胞瘤、宫颈癌、胃癌、卵巢癌和乳腺癌。同时有研究发现，MNX1-AS1 水平的升高预示着 GC 患者的不良预后，MNX1-AS1 对 GC 具有促进作用。然而，在 GC 中，MNX1-AS1 失调背后的多种机制在很大程度上仍是未知的。本研究旨在全面探讨 MNX1-AS1 介导的 GC 进展机制模型。

生信分析

BTG2 是 GC 中 MNX1-AS1 的关键下游目标。a. 对照组与 si MNX1-AS1 组 RNA 转录序列的散点图。b. 分级聚类基因转录在 SGC7901 细胞中 MNX1-AS1 敲除后发生改变（倍数变化大于 1.5)。c. GO 分析 MNX1-AS1 基因敲除后的所有突变基因。我们使用 qRT-PCR 检测来选择性地检测参与 GC 进展的几个基因的改变。在 MNX1-AS1 敲除的 GC 细胞中，e. BTG2 在 mRNA 和蛋白水平上都有明显的表达