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ceRNA（竞争性内源 RNA）是近几年的研究热点，已知 microRNA 可以通过结合 mRNA 导致基因沉默，而 ceRNA 可以通过竞争性地结合 microRNA 来调节基因表达。ceRNA（常见的为 lncRNA 和 circRNA）可以通过应答元件（microRNA response elements, MREs) 与 microRNA 结合从而影响 microRNA 导致的基因沉默。相较于 microRNA 调控网络，ceRNA 作为一种全新的基因表达调控模式，其更为精细和复杂，涉及更多的 RNA 分子。伯豪 ceRNA 芯片（可同时检测 circRNA、lncRNA、mRNA）自推出以来，已助力众多科研工作者在 ceRNA 研究领域取得了喜人的研究成果，发表了十多篇 ceRNA 研究文章，总影响因子 88.91，平均影响因子为 5.23。

ceRNA 芯片作为高性价比的高通量筛选工具，能够一次性筛选分析实验组和对照组的大量差异基因，那么如何从众多的差异结果里挑选出实验相关的具有代表性的 ceRNA(circRNA/lncRNA) 进行后续的功能机制研究呢，下面的几篇伯豪客户的 ceRNA 文章将给大家提供一些思路。

circTP63 作为 ceRNA 通过上调 FOXM1 促进肺鳞状细胞癌进展

发布期刊：

Nat Commun (IF:11.87)

关键词：

肺鳞状细胞癌、ceRNA、FOXM1、细胞周期

研究背景：

非小细胞肺癌（NSCLC）是肺癌的主要组织学类型，其中肺鳞状细胞癌（LUSC）和肺腺癌（LUAD）是主要的亚型，目前针对特定基因突变的靶向药物的开发极大地改善了晚期 LUAD 患者的治疗，但是 LUSC 的治疗尚不明朗，因此寻找治疗 LUSC 的潜在分子靶点变得尤为重要。近年来，circRNA 作为一种新型的调控 RNA 分子，引起了广泛的关注，但目前尚未全面探讨 circRNA 在 LUSC 中的作用和机制。

研究内容：

本文研究人员利用 ceRNA 芯片检测了 5 对 LUSC 患者组织中 circRNA 和 mRNA 的表达谱。通过分析差异表达的 circRNA 和 mRNAs 的共表达网络，发现细胞周期相关的 circRNA circTP63 在 LUSC 组织中上调，且其上调与 LUSC 患者肿瘤体积较大、TNM 分期较高有关。circTP63 的表达升高促进了癌细胞在体内和体外的增殖。从机理上讲，circTP63 与 FOXM1 共享 miRNA 反应元件。

研究结论：

circTP63 竞争性地与 miR-873-3p 结合，解除其对 FOXM1 表达抑制作用，进而上调 CENPA 和 CENPB，推动细胞周期进展。

目标 ceRNA 锁定思路：

研究人员通过对 ceRNA 芯片结果中差异 mRNA 富集到的通路进行分析，发现细胞周期是显著富集到的通路，将细胞周期相关的 109 个 mRNA 与差异显著的前 100 个 circRNA 进行共表达分析，挑选出与细胞周期密切相关的 6 个 circRNA，然后通过 qPCR 定量验证锁定目标 circRNA。

图 1：LUSC 中目标 circRNA 分析流程图

脂肪细胞外泌体 circRNA 通过靶向去泛素化相关的 USP7 促进肝细胞癌的生长

发布期刊：

Oncogene (IF:6.63)

关键词：

肝细胞癌、去泛素化、circRNA、外泌体

研究背景：

肝细胞癌（HCC）是肝癌的主要形式，其发病率呈升高趋势，预后表现很差。脂肪组织通过脂肪因子的分泌在能量储存和代谢调节中发挥作用。环状 RNA(circRNAs) 是一种新型的非编码 RNA，近期报道显示它与肿瘤发生息息相关，但从脂肪组织中提取的外泌体 circRNA 的作用尚未明确。

研究内容：

脂肪分泌的 circRNA 能调节 HCC 的去泛素化，从而促进细胞生长。外泌体环去泛素化（circ-DB) 在体脂率较高的 HCC 患者中上调。体内外的研究显示，exocirc-DB 通过抑制 miR-34a 和激活与去泛素化相关的 USP7，来促进 HCC 生长并减少 DNA 损伤。结果表明，脂肪外泌体对肝癌细胞的作用可通过敲降 circ-DB 来逆转。

研究结论：

脂肪细胞分泌的外泌体 circRNA 通过抑制 miR-34a，激活 USP7/ Cyclin A2 信号通路，促进肿瘤生长并减少 DNA 损伤。

目标 ceRNA 锁定思路：

基于已有研究成果，即 miR-34a 在 HCC 细胞中参与调控 β -catenin 的，Cyclin A2 是 USP7 的重要下游靶基因，USP7/ Cyclin A2 信号通路的激活促进了乳腺癌的进展。研究人员对脂肪细胞外泌体找那个 USP7 相关的 circRNA 进行分析，锁定目标 circRNA。

circFMN2 通过调节 miR-1182/hTERT 信号通路促进结直肠癌的进展

发布期刊：

Clin. Sci.  (IF:5.24)

关键词：

结直肠癌、外泌体、circRNA

研究背景：

环状 RNA(CircRNAs) 是一类在各种细胞中广泛表达的非编码 RNA。然而，目前 circRNA 在结直肠癌（CRC) 中的分子机制尚清楚。本文研究的目的是试图从 circRNA-microRNA(MiRNA)-mRNA 相互作用的角度为结直肠癌的靶向治疗提供新的依据。

研究内容：

采用 ceRNA 芯片技术检测了 5 对 CRC 癌组织及癌旁组织中 circRNA 的表达情况，并对差异表达的 circRNA 进行了分析。研究人员重点研究了位于 1 号染色体上，起源于 FMN2 的 circRNA has_circ_0005100，并将其命名为 circFMN2。利用 qPCR 检测了 88 例 CRC 癌组织和细胞系中 circFMN2 的表达，并通过功能分析来评价 circFMN2 在体内外对细胞增殖、肿瘤形成的影响。生物信息学分析预测，荧光素酶报告实验证实了 circFMN2、miR-1182、hTERT 的直接相互作用。

研究结论：

circFMN2 通过与 miR-1182 结合，解除 miR-1182 对 hTERT 的抑制作用，促进 hTERT 表达，进而促进结直肠癌的进展。

目标 ceRNA 锁定思路：

研究人员对 ceRNA 芯片结果中差异显著的前 10 个利用 qRT-PCR 进行扩大样本量验证，将芯片和 qRT-PCR 表达趋势一致，表达量高的 circRNA 锁定为目标 ceRNA。

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