伯豪生物
Shbio lncRNA 芯片

lncRNA 芯片特点

目前市面上探针密度高的 lncRNA 芯片产品之一;

芯片采用 Agilent eArray 平台设计,使用 Agilent SurePrint 技术合成,技术重复性高于 99%;

覆盖主流数据库所有 lncRNA,可同时检测 lncRNA 和 mRNA,并挖掘两者之间的关联;

检出率高:随机引物扩增方式,可同时扩增带 Ploy- A 和不带 Poly- A 的 lncRNA,确保更多的 lncRNA 被检测出来。

lncRNA 芯片应用

筛选与特定疾病相关的差异表达 lncRNA 和 mRNA,lncRNA 的 cis/trans 靶基因预测及 lncRNA 功能调控分析。

芯片介绍

伯豪生物 lncRNA 芯片介绍

伯豪优势

成熟的服务平台:稳定而系统的芯片实验全面解决方案,可为客户提供总 RNA 抽提、样品质检、RNA 标记、杂交、洗脱、图像扫描、数据分析等一系列服务。

专业的实验人员:从 RNA 抽提到芯片杂交均配备有专业的实验人员,具有丰富的芯片实验操作经验,遵循严格的质控标准,层层把关确保高质量完成实验。

强大的分析团队:实战经验丰富的分析团队,除能快速完成基础分析外,还能根据客户需求完成个性化分析,提供各类高大上的图表。

稳健的支持团队:一对一服务,为您解决项目全过程中的各类问题,包括但不限于项目方案制定、样本收集、数据结果解读、数据深度挖掘及文章发表支持等。

样本要求

伯豪生物 lncRNA 芯片样本要求

分析流程

伯豪生物 lncRNA 芯片分析流程

案例展示

案例一

研究背景

外泌体是由多种细胞分泌的纳米级膜囊小泡,其内含有蛋白质、脂质、核酸等大量生物活性物质,在细胞间通讯过程中起着关键作用。在整个肿瘤组织的浸润区,巨噬细胞约占 50%, 有研究结果表明,巨噬细胞的数量同肿瘤的预后呈负相关,说明了巨噬细胞在肿瘤发展过程中具有重要作用。肿瘤浸润区巨噬细胞能够分泌外泌体,本研究着重关注外泌体中 lncRNA 对肿瘤代谢过程的影响。

研究思路

伯豪生物 lncRNA 芯片研究思路

研究结果

研究人员通过全转录组测序及 lncRNA 芯片技术(全转录组测序、lncRNA 芯片由伯豪生物提供)对巨噬细胞外泌体来源的 RNA 进行检测,分析结果显示肿瘤微环境中发生糖酵解的肿瘤细胞释放的乳酸能够通过反馈调节,上调巨噬细胞释放的 HISLA,从而维持巨噬细胞来源的外泌体中 HISLA 的高丰度。阻断外泌体 HISLA 的运输,能够抑制乳腺肿瘤的糖酵解反应和化疗抗药性。该研究强调了巨噬细胞释放的外泌体 lncRNA 作为细胞信号传导载体的潜力,其在肿瘤微环境中进行细胞间传递,调控着肿瘤的代谢活动。

伯豪生物 lncRNA 芯片研究结果

参考文献

Chen Fei, Chen Jianing, Yang Linbin et al. Extracellular vesicle-packaged HIF-1α-stabilizing lncRNA from tumour-associated macrophages regulates aerobic glycolysis of breast cancer cells.[J] .Nat. Cell Biol., 2019, 21: 498-510.

案例二

研究背景

先天性免疫应答具有抵抗传染性微生物和驱动病理性炎症的能力,能够预防诸如败血症,动脉粥样硬化,肥胖症,自身免疫和癌症等疾病的发生发展。Toll 样受体(TLR)是先天免疫系统中的模式识别受体(PRR),并且每个 TLR 识别特定的病原体分子模式(PAMP)。由革兰氏阴性菌合成的脂多糖(LPS)能够通过 TLR4 刺激细胞,对免疫反应具有深远的影响。有报道称长链非编码 RNA(lncRNA)在多种生物学过程和疾病中起重要作用,因此研究人员想要探究 lncRNA 是否在 LPS 引起的免疫反应中起一定的作用。

研究思路

伯豪生物 lncRNA 芯片研究思路

研究结果

利用上海伯豪 SBC Mouse (4x180 K) lncRNA 芯片对 LPS 处理过的 C57BL/6 小鼠腹腔巨噬细胞进行差异表达 lncRNA 筛选,通过 qRT-PCR 确定 lncRNA Mirt2 参与 LPS 引起的 TLR4 信号通路,且 Mirt2 的表达量与 LPS 的诱导时间和剂量相关。对 Mirt2 的上游调控因子进行研究发现 Mirt 包含两个独立的信号转换器和转录激活因子 1(Stat1)结合位点,Stat1 与 LPS 引起的 Mirt2 高表达密切相关,Stat6 与 IL- 4 引起的 Mirt2 表达下调相关。此外,研究发现 Mirt2 抑制 TRAF6 的寡聚化和自体泛素化,进一步研究发现 Mirt2 能够抑制相关炎症因子的表达,对 LPS 引起的内毒素血症有一定的抑制作用。

lncRNA 芯片研究结果分享

参考文献

Du Meng, Yuan Lin, Tan Xin et al. The LPS-inducible lncRNA Mirt2 is a negative regulator of inflammation.[J] .Nat Commun, 2017, 8: 2049.

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