伯豪生物
文献锦集 | 全球第一大癌症文献研究与应用
发布时间:2021-03-16 浏览次数:177
世界卫生组织国际癌症研究机构(IARC)近日发布了2020年全球最新癌症数据,数据显示2020年全球乳腺癌新发病例高达226万,超过了肺癌的220万,乳腺癌取代肺癌,成为全球第一大癌症。

全球乳腺癌死亡人数达到 68 万例,占全球女性癌症死亡总数的 15.5%,成为全球死亡人数最多的女性癌症。在中国,乳腺癌也是女性新发癌症病例数最多的癌症,2020 年新发病例达到了 42 万。

1

2020 年全球女性癌症新发病例数和死亡病例数前十的癌症类型

小编去搜索发现乳腺癌相关的文献数量大并且逐年攀升,以下 3 篇是在基因组水平的涉及大型乳腺癌队列易感基因分析、乳腺癌基因组学特征、乳腺癌的多基因风险评估。


文献 1:11 万样本关联分析揭示乳腺癌易感基因

2

标题:11 万样本关联分析揭示乳腺癌易感基因

时间:2021/2

期刊:The new england journal of medicine(IF 74.699)

单位:国际乳腺癌学会联盟

平台:Targeted DNA sequencing(34 genes)

摘要:乳腺癌易感基因检测已被广泛应用,但是对许多基因而言,与乳腺癌的潜在风险推算商不精准,并且缺乏可靠的亚型相关风险推算。国际乳腺癌学会联盟对来自 25 个国家 11.3 万多例女性 34 个基因与乳腺癌风险的关联进行了分析。该人群病例 - 对照研究对 34 个可能易感基因大规模并行测序,将这些基因蛋白质截断变异和罕见错义变异进行单独分析,比较全部乳腺癌和各个亚型乳腺癌的比例。全部乳腺癌女性与对照女性相比:5 个基因(ATM、BRCA1、BRCA2、CHEK2、PALB2)蛋白质截短变异比例显著较高(P<0.0001)。4 个基因(BARD1、RAD51C、RAD51D、TP53)蛋白质截短变异比例相对较高(P<0.05)。3 个基因(ATM、CHEK2、TP53)罕见错义变异比例显著较高(P<0.001)。3 个基因(BRCA1、BRCA2、TP53)致病错义变异比例显著较高,与蛋白质截短变异比例相似。这项研究的结果定义了在临床中最有用的基因,用于乳腺癌风险的预测,并提供了蛋白质截断变异相关风险的估计及指导遗传咨询。


文献 2:8401 名乳腺癌病例分析易感基因及多基因风险评估

3

标题:8401 名乳腺癌病例分析易感基因及多基因风险评估

时间:2020/12

期刊:Nature Communications(IF 12.121)

平台:Illumina / Affymetrix arrays 

摘要:乳腺癌多基因风险评分(PRS) 有可能改善风险预测情况,但其在各种临床情况下的应用信息非常有限。本研究团队在 FinnGen 研究的 122,978 名女性中发现了 8401 例乳腺癌病例,PRS 改变了两种高影响力移码突变的乳腺癌患病风险。研究发现在乳腺癌诊断后,PRS 升高的个体发展为对侧乳腺癌的风险也相应增加,并且 PRS 可以显著改善其一级女性亲属的风险评估结果。更为详细的研究显示,在携带 PALB2 c.1592delT 突变的女性和平均 PRS(10-90% 百分位数)女性的终生患乳腺癌的风险是 55%,而 PRS 评分高的(> 第 90 个百分位数)风险升到 84%(71-97%),PRS 评分低的(<10 个百分位数)风险降到 49%(30-68%)。CHEK2 c.1100delC 突变的携带者(n=1648)各评分患病风险分别为 29%(27-32%)、59%(52-66%)和 9%(5-14%)。尤其对那些有早发性乳腺癌家族史的女性,PRS 可以显著改善风险评估。

4


文献 3:转移性乳腺癌的基因组学特征

5

标题:转移性乳腺癌基因组学特征

时间:2021/2

期刊:Clinical Cancer Research(IF 10.107)

平台:Targeted DNA sequencing(OncoPanel)

摘要:本研究对 926 例原发性或转移性乳腺癌患者(212 例 dnMBC 和 714 例 rMBC)进行靶向 DNA 测序(OncoPanel)。将未经治疗的 dnMBC 原发性肿瘤与最终发展为 rMBC 的患者中的原发肿瘤中的单核苷酸变异、拷贝数变异和肿瘤突变负担(TMB)与所有 dnMBC 中的 OS 相关性进行比较分析。在按亚型比较原发性肿瘤时,与 rMBC 相比,MYB 扩增在三阴性 dnMBC 中非常明显(21.1% vs 0%,P = 0.0005, q = 0.111)。在初级 HR + / HER2 - dnMBC 与 RMBC 的肿瘤中 KMTD2、SETD2 和 PIK3CA 突变更普遍,TP53 和 BRCA1 相对不太普遍。TP53、MYC 和细胞周期通路基因突变 dnMBC 患者的 OS 更短。三阴性 dnMBC 中高 TMB 与更好的 OS 相关(P = 0.041)。未经治疗的 dnMBC 与发展为 rMBC 的患者的原发肿瘤之间的基因组差异可能为 dnMBC 潜在的转移潜力和不同的治疗敏感性提供了依据。dnMBC 较差的 OS 相关结果说明需要新颖的方法来克服当前疗法的潜在抗性。

6

这 3 篇文献都是基于大样本量的分析研究,1 篇利用传统的基因芯片的手段,2 篇利用了性价比极高、使用越来越广泛的定制基因 panel 测序的手段,从不同角度揭示了乳腺癌的基因组学特征和疾病易感基因的研究成果,为后续研究和临床应用提供参考。其他肿瘤研究也有类似情况,或可借鉴其研究思路。特别地,文献中应用的定制基因 panel 测序因其成本低、个性化的特点受到了越来越多的青睐。

伯豪生物提供全外、全基因组测序、Illumina /Affymetrix  基因芯片常规服务之外,定制基因 panel 测序服务可满足不同的研究需求,详情请咨询伯豪生物市场部。


更多伯豪生物人工服务:

伯豪学院单细胞测序服务人工客服