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龙行龘龘 |935K 甲基化芯片福利来袭
发布时间:2024-02-18 浏览次数:502
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935K 甲基化芯片(Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip)是一种全基因组甲基化筛选工具,靶向人类甲基化组最具生物学意义的区域中超过 935,000 个 CpG 位点,同时在其前代产品 Methylation EPIC v1.0(850K)的基础上极大的提高了向后兼容性。该芯片保留了以单核苷酸分辨率定量分析全基因组 CpG 的能力,同时提供高度准确和精确的甲基化测量,不受测序深度的影响。可使用精简、用户友好的 Infinium 甲基化检测分析多种 DNA 样本类型,包括从 FFPE 分离的 DNA 样本。与其他方法相比,Methylation EPIC v2.0 具有可扩展性和更低的单个样本总成本,因此可用于探究疾病机制和生物标志物的筛选。


活动福利

 50 个样本   送 好礼   

满  100 个样本   更有   豪礼加送


项目周期: 自 DNA 质控合格后标准生信分析结果发送 10 个工作日;

交付结果: 标准生信分析报告和原始数据;

DNA 要求: 常规 DNA 总量≥1ug,浓度≥50ng/μl,OD260/280 在 1.8 左右;不得有其它个体或其它物种的 DNA 或 RNA 污染;溶解在 H20 或 TE (pH 8.0),特殊样本视具体情况实验。

活动时间:2024 年 2 月 18 日至 2024 年 5 月 31 日

活动说明:

1、合同双方签订完成时间必须在活动时间内;

2、单次送样数目为 8 的倍数;

3、活动最终解释权归伯豪生物所有。


935K 芯片优势

  • 全面的基因组覆盖范围: 检测 > 935,000 个 CpG 位点,全面覆盖 CpG 岛、启动子、编码区及增强子。

  • 探针位点的全面优化: 在 EPICv1.0-850K 的基础上去除了性能不佳的探针,新增 186,000 个 CpG 靶向增强子和超级增强子、更多 CTCF 结合位点、CNV 检测区域、EPIC v1.0 覆盖不足的 CpG 岛以及常见癌症驱动突变。

  • 兼容多种样本类型: 包括 FFPE、新鲜 / 冷冻组织、全血、口腔细胞、cfDNA、唾液和其他样本类型。

  • 高质量的数据: 沿用了 450K 芯片的 Infinium 技术,同时采用 Infinium I 及 II 探针设计,使检测范围最大化。

  • 分辨率高: 单碱基分辨率,可以直接检测到发生甲基化的准确位点。

  • 可重复性高: 自身技术重复间的相关性以及与 850K 相同探针间的相关性 R2>0.99。

  • 注释信息: 人参考基因组版本更新到 hg38,GenCode 数据库更新到 v41 版本。


  • 935K 与 850K 芯片数据相关性

    935K 甲基化芯片检测能够检测到 0.2 的 beta 值差异,假阳性率低于 1%,从而实现了较高的分析灵敏度,同时也具有极好的数据可重现性。

    如下图:

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    (A)935K 芯片技术重复相关性 R 2>0.99;

    (B)935K 芯片和 850K 的交集探针间的相关性 R 2>0.99;

    (C)935K 芯片数据与甲基化测序(100X 测序深度)的相关性 R 2>96%。


    935K 芯片实测数据展示

    严格按照 Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip(简称 935K)操作手册完成 DNA 抽提、转化、扩增、杂交洗脱等,质控结果说明杂交实验过程稳定、转化率高、荧光信号和结合状况良好,综合说明实验操作稳定,可以进一步做甲基化的数据分析。

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