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【标题】结肠癌骨髓靶向治疗机制的单细胞分析

【平台】10X

【期刊】Cell（IF=36.2）

【时间】2020-04-16

【摘要】单细胞转录组测序（scRNA-seq) 是鉴定肿瘤细胞多样性的重要工具，但其在免疫调节疗法机制的探索中的应用并不多。研究者对结直肠癌患者的免疫和基质细胞群体进行 scRNA-seq 分析，确定特异性巨噬细胞和经典树突状细胞（cDC) 亚群是肿瘤微环境中细胞互作的关键介质。在小鼠肿瘤中鉴定可比较的髓样细胞群能够描述其对髓样靶向免疫治疗的反应。抗 CSF1R 治疗优先耗竭具有炎症特征的巨噬细胞，但保留小鼠和人类表达促血管生成 / 肿瘤基因的巨噬细胞群。用 CD40 激动剂抗体治疗可优先激活 cDC 人群，增加 Bhlhe40+Th1 样细胞和 CD8+ 记忆性 T 细胞。作者对人和小鼠的主要髓细胞亚群的综合分析揭示了调节肿瘤免疫关键细胞的相互作用，并明确了目前正在进行临床试验的髓细胞靶向免疫疗法的机制。

【标题】COPD 肺纤维化与炎症的再生化生克隆

【期刊】Cell（IF=36.2）

【平台】10X

【时间】2020.04.30

【摘要】慢性阻塞性肺病（COPD）是一种慢性支气管炎、小气道阻塞和肺气肿的进展性疾病，是世界范围内的主要死亡原因。虽然炎症、纤维化、粘液高分泌和上皮化生损伤是本病的特征，但它们的起源和依赖关系仍不清楚。本文将单细胞克隆技术应用于 COPD 患者和非 COPD 患者的肺组织。与对照肺不同，COPD 肺由正常的远端气道祖细胞支配，由三种不同的祖细胞浸润，这些祖细胞在表观遗传学上表现为明显的化生损伤。当移植到免疫缺陷小鼠身上时，这些变异克隆引起的病理变化类似于慢性阻塞性肺病的粘膜和鳞状上皮化生、中性粒细胞炎症和纤维化。

【标题】免疫治疗细胞基因工程的联合靶向敲除

【平台】10X

【期刊】Cell (IF=36.2)

【时间】2020.04.30

【摘要】基因修饰免疫细胞的过继转移为肿瘤免疫治疗提供了广阔的前景。CRISPR 靶向基因敲除可以改善细胞治疗，但需要更多的高通量方法来检测哪些基因敲除能增强体内原代细胞功能。作者开发了一种广泛适用于条形码和跟踪大型非病毒 DNA 模板的定向整合技术，并将其应用于在人类原代 T 细胞的联合敲除筛选。将数十个独特的条形码模板整合到 T 细胞受体（TCR）基因座中，揭示了增强体内外适应性的基因结构。作者进一步开发了联合靶向敲除测序（PoKI-seq），结合单细胞转录组分析和联合敲除筛选来检测细胞丰度和细胞在体内外的状态。该平台鉴定了一种新的转化生长因子 b（TGF-b）R2-41BB 嵌合受体，可提高实体瘤的清除率。

【标题】迷走神经传入的遗传控制清除揭示了气道防御机制

【平台】10X

【期刊】Cell (IF=36.2)

【时间】2020-04-16

【摘要】感觉神经元启动防御反射，确保气道完整。喉神经元的功能障碍是危及生命的，可导致肺吸入、吞咽困难和窒息，但相关的感觉通路仍不清楚。在这里，我们发现了罕见的喉神经支配神经元（约 100 个神经元 / 老鼠）保护呼吸道免受攻击。作者使用广泛覆盖迷走神经 / 舌咽感觉神经元图谱的遗传工具来绘制、消融和控制特定的传入群体。迷走神经 P2RY1 神经元的光生激活引起相应的气道防御反应：呼吸暂停、声带内收、吞咽和呼气反射。消除迷走神经 P2RY1 神经元可消除对喉水和酸刺激的保护性反应。上皮细胞是主要的气道前哨细胞，通过 ATP 与二级 P2RY1 神经元进行通讯。这些发现为研究气道防御机制和迷走神经对内脏器官的感觉提供了一个通用的分子 / 基因路线图。

【标题】皮肤有效修复离不开真皮脂肪细胞的脂解及向肌成纤维细胞的转化

【平台】10X

【期刊】Cell Stem Cell (IF=21.5)

【时间】2020.04.15

【摘要】成熟脂肪细胞储存脂肪酸，是组织基质的一种常见成分。脂肪细胞在调节骨髓、皮肤、肌肉和乳腺生物学中的作用研究较多，但是脂肪细胞衍生的脂质在组织内稳态和修复中的作用还不清楚。在此，作者发现了脂肪细胞脂解在调节皮肤损伤后炎症和修复中的重要作用。遗传小鼠研究表明真皮脂肪细胞在损伤后引发炎症和促进随后的修复是必要的。作者通过组织学、超微结构、脂质体和基因实验发现，皮肤损伤附近的脂肪细胞会引发巨噬细胞炎症所必需的脂质释放。三苯氧胺诱导的成熟脂肪细胞遗传谱系分析和单细胞 RNA 测序显示，真皮脂肪细胞发生分化，在伤口内产生肌成纤维细胞（生 -ECM）。因此，脂肪细胞参与修复的多个方面，其可能对炎症性疾病有治疗作用，也与衰老和糖尿病相关的伤口愈合不良有关。