三月份单细胞高分文献汇总
三月份单细胞测序相关文献共收集到 33 篇(IF>9),文末表中列出文献发表期刊、研究方向和技术平台等信息,接下来先看看其中 6 篇。
三月份单细胞高分文献汇总
三月份单细胞测序相关文献共收集到 33 篇(IF>9),文末表中列出文献发表期刊、研究方向和技术平台等信息,接下来先看看其中 6 篇。
【标题】在单细胞水平上构建人类细胞图谱
【平台】Microwell-seq
【期刊】Nature(IF=43.1)
【时间】2020-03-25
【摘要】单细胞分析是研究复杂系统中细胞异质性的重要工具。然而,一个完整的单细胞图谱还没有被用于人类。研究人员使用单细胞 mRNA 测序来确定所有主要人体器官的细胞类型组成,并构建了一个人类细胞图谱(HCL) 方案。研究人员揭示了许多组织的单细胞层次结构,但这些组织的特征还不清楚。研究人员建立了一个“单细胞 HCL 分析”流程,帮助定义人类细胞身份。研究人员对人类和小鼠的图谱进行了单细胞比较分析,以揭示保守的遗传网络。研究人员发现,干细胞和祖细胞表现出很强的转录随机性,而分化的细胞则更加明显。本文的研究为人类生物学提供了宝贵的资源。
【标题】保守的树突状细胞调节程序限制抗肿瘤免疫
【平台】10X【期刊】Nature(IF=43.1)
【时间】2020-03-25
【摘要】检查点阻断疗法改善了癌症治疗,但这种免疫治疗方案在很大一部分患者中失败。传统的 1 型树突状细胞(DC1s)在临床前模型中控制对检查点阻断的反应,并与癌症患者更好的总体生存率相关,反映了这些细胞启动 CD8+ T 细胞 1 - 3 反应的特殊能力。然而,矛盾的是,在抵抗检查点阻断的肿瘤中可以发现 DC1,这表明这些细胞的功能可能在某些病变中发生改变。在这里,利用人类和小鼠非小细胞肺癌中的单细胞 RNA 测序,作者鉴定了一组树突状细胞(DC),称之为“富含免疫调节分子的成熟树突状细胞”(mregDCs),因为它们共同表达免疫调节基因(Cd274、Pdcd1lg2 和 Cd200)和成熟基因(Cd40、Ccr7 和 Il12b)。同时发现 mregDC 程序在肿瘤抗原摄取后由典型的 DC1s 和 DC2s 表达。作者进一步发现,mregDCs 中一个关键的检查点分子程序性死亡配体 1 蛋白的上调是由受体酪氨酸激酶 AXL 诱导的,而白细胞介素(IL-12)的上调严格依赖于干扰素 -γ,并受 IL- 4 信号的负性控制。阻断 IL- 4 可增强携带 mregDC1s 的肿瘤抗原产生 IL-12,扩大肿瘤浸润效应 T 细胞池,减轻肿瘤负担。因此,作者发现了一个与肿瘤抗原摄取相关的调节模块,它降低了人类和小鼠癌症中 DC1 的功能。
【标题】从成体 Procr+ 祖细胞培养获得胰岛类器官
【平台】10x
【期刊】Cell(IF=36.2)
【时间】2020.03.19
【摘要】体外制造功能性 β 细胞通常是具有挑战性的。本文中,研究人员通过单细胞 RNA 测序(scRNA-seq),描述了一种以前未被识别的成年小鼠胰腺蛋白 C 受体阳性(Procr+) 细胞群。这些细胞存在于胰岛,不表达分化标记物,具有上皮 - 间质转化的特征。通过遗传谱系追踪,Procr+ 胰岛细胞克隆扩增,并在成年期产生所有四种内分泌细胞类型。分选后的 Procr+ 细胞,占胰岛细胞总数的 1%,在克隆密度下培养时可稳定地形成胰岛类器官。通过连续传代,可以在较长时间内保持指数扩增,而在培养的任何时间点都可以诱导分化。在分化胰岛器官中,β 细胞占主导地位,而 α、δ、PP 细胞发生在较低的频率。类器官对葡萄糖有反应并分泌胰岛素。在糖尿病小鼠移植后,这些器官逆转了疾病。这些结果表明,成年小鼠胰岛含有 Procr+ 内分泌祖细胞群。
【标题】小胶质细胞以 IL- 6 依赖的方式再生促进大脑修复
【平台】10x(ST)
【期刊】Cell(IF=36.2)
【时间】2020.03.05
【摘要】认知功能障碍和反应性小胶质细胞是创伤性脑损伤(TBI) 的标志,然而这些细胞是否会导致认知功能障碍和继发性炎症病理仍然知之甚少。本文中,研究人员证明了从小鼠大脑中去除小胶质细胞对 TBI 的结果几乎没有影响,但是通过药理学或遗传学方法诱导这些细胞的周转可以产生一种神经保护的小胶质细胞表型,这将极大地帮助恢复。这些新生小胶质细胞的有益作用严重依赖于通过可溶性 IL- 6 受体(IL-6R) 传递白介素 -6 (IL-6) 信号,并有力地支持成体神经发生,特别是通过增加直接支持认知功能的新生神经元的存活。研究人员的结论是,在哺乳动物的大脑中,小胶质细胞可以被控制成一种神经保护和前再生表型,可以帮助修复和减轻由脑损伤引起的认知缺陷。
【标题】单细胞转录组分析揭示了经典霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中疾病定义 T 细胞亚群
【平台】10x
【期刊】Cancer Discovery(IF=26.4)
【时间】2020-03
【摘要】霍奇金淋巴瘤的特点是具有广泛优势的肿瘤微环境(TME),由不同类型的非癌性免疫细胞和罕见的恶性细胞组成。细胞成分及其空间关系的特征对于理解 TME 中的串扰和治疗靶向至关重要。研究人员对来自 22 个霍奇金淋巴瘤组织标本和 5 个反应性淋巴结的 127,000 多个细胞进行了单细胞 RNA 测序,以单细胞分辨率描绘了霍奇金淋巴瘤特异性免疫微环境的表型。单细胞表达谱鉴定了一个新的霍奇金淋巴瘤相关的 T 细胞亚群,该亚群具有显著的抑制性受体 LAG3 的表达,功能分析证实了 LAG3+ T 细胞群作为免疫抑制的中介。对微环境中免疫细胞的多方面空间评估也显示,在 MHC Ⅱ类缺陷肿瘤细胞的附近,LAG3+ T 细胞增加。研究人员的发现为 TME 生物学提供了新的见解,并为霍奇金淋巴瘤的免疫检查点靶向提供了新的方法。
【标题】单细胞 RNA 测序揭示乳腺癌转移的转录多样性和生物能量转移
【平台】Smart-seq2
【期刊】Nature Cell Biology(IF=17.7)
【时间】2020.03.06
【摘要】虽然转移仍然是大多数癌症相关死亡的原因,但远端组织的扩散机制尚不清楚。本文中,研究人员建立了一种可靠的方法,利用单细胞 RNA 测序和乳腺癌患者衍生的异种移植模型,来识别在传播期罕见转移细胞的整体转录组改变。研究人员发现原发肿瘤和微转移均表现出转录异质性,但微转移在病人衍生的异种移植模型中存在一个独特的转录机制,该机制可高度预测病人的不良生存期。通路分析显示,线粒体氧化磷酸化是微转移中上调的主要通路,而原发性肿瘤细胞中糖酵解酶水平较高,研究人员通过流式细胞术和代谢组学分析证实了这一点。氧化磷酸化的药理学抑制显著减弱了肺转移性播散,这表明了氧化磷酸化在转移中的功能重要性,并突出了其作为一个治疗靶点的潜力,以防止乳腺癌患者的转移性扩散。
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