越来越多的证据表明,阿尔茨海默氏病(AD)是一种普遍的代谢性疾病,发病机理涉及多种生化途径的失调。目前对AD的治疗方法为抗淀粉样β(Aβ)蛋白疗法,但是该方法治愈率低。所以确定AD发病机制的新靶点对于开发有效的治疗方法至关重要。
伯豪生物每月汇总单细胞文章,希望对各位老师的关注或研究有帮助!4月份单细胞测序相关文献共收录36篇(IF>9),我们选取其中5篇与大家分享,并在文末附表中列出文献发表期刊、研究方向和技术平台等信息。重要!不用再费时搜索,也不用费力下载,轻松了解单细胞文章信息,文末可领取4月单细胞文章合集!
高通量测序技术的发展为人类疾病机制研究、遗传病诊断、产前筛查与诊断、肿瘤诊断与治疗等带来了新的应用机遇。全外显子组测序,是利用序列捕获技术将全基因组外显子区域的DNA捕捉并富集后,进行高通量测序的基因组分析方法。
上一回,我们着重讲述了为何要进行蛋白检测。其中几个关键参数大家一定记住了吧!比如在全基因组中,mRNA和蛋白质表达水平之间的相关性很差,在许多研究中的解释力(explanatory power)徘徊在40%左右。这一回,我们来讲述如何进行蛋白质检测。
之前我们略述了代谢组学的课题设计,按照设计的思路进行实验后,就需要进行代谢样本的收集了。今天咱按照不同类型的样本,给大家提供一点收集的建议。
在有限的细胞核空间中,基因组的大部分是紧密折叠的,仅留下需要转录的部分是开放的。打开的染色质,就允许一些调控蛋白(比如转录因子和辅因子)跑过来与之相结合。而染色质的这种特性,就叫做染色质的可及性(chromatin accessibility)。ATAC-seq是利用高通量测序检测转座酶易接近的染色质的技术。 ATAC-seq只需要很少的细胞就能鉴定基因组中所有活跃的调控序列。
DNA甲基化(DNA methylation)是目前研究得清楚、也是重要的表观遗传修饰形式,主要是基因组DNA上的胞嘧啶第5位碳原子和甲基间的共价结合,胞嘧啶由此被修饰为5甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)。别看这只是一个小小的改变,它所起到的作用却是巨大的!有些科学家甚至将DNA甲基化叫做“第五种碱基”!