发布时间:2022-08-15 浏览次数:8496
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科研技术服务平台多样 满足不同样本实验需求
▲伯豪生物(部分)技术平台展示
空间转录组是从空间层面上解析 RNA-seq 数据的技术,通过对组织切片、测序获得组织空间中的 mRNA 表达信息、 定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达 。
序号 | 技术服务 | 应用领域 | 样本 |
1 | FFPE 空间转录组测序 [科研服务] | ★肿瘤学;★免疫学;★生长发育;★神经科学;★病理学 ; ★多组学联合(例如:单细胞转录组 + 空间转录组等) | FFPE (临床样本) |
2 | 空间转录组测序 [科研服务] | ★肿瘤学;★免疫学;★生长发育;★神经科学;★病理学 ; ★多组学联合(例如:单细胞转录组 + 空间转录组等) | 新鲜冰冻组织 |
3 | Visium HD | 空间基因表达 [科研服务] | ★肿瘤研究;★免疫研究;★生长发育;★神经科学。★多组学联合。 | FFPE (人 / 小鼠) |
4 | 亚细胞空间 |Xenium 原位分析 [科研服务] | ★肿瘤研究;★免疫研究;★生长发育;★神经科学;★病例诊断; ★新药研发。 ★多组学联合。 | 人 / 小鼠 定制 panel |
普通转录组 VS 单细胞转录组 VS 空间转录组 | ||
普通转录组 得到组织中混合细胞(bulk)表达情况,无法解析细胞表达异质性,即无法得到每个细胞的表达情况。 | 单细胞转录组 10x genomics 等单细胞转录组测序技术可以得到每个细胞的表达情况,从而解析组织内细胞异质性。 | 空间转录组 10x visium 等将组织切片与转录组测序结合,实现空间信息和转录本信息的获取。添加基因表达空间分布信息,进一步提高组织内部分辨率。 |
序号 | 协助客户发表文章 | 杂志 | IF | 日期 | 样本类型 |
1 | Abnormal metabolism in melanocytes participates in the activation of dendritic cell in halo nevus | CLINICAL IMMUNOLOGY | 8.6 | 2024 | 晕痣 |
2 | Single-cell and spatial heterogeneity landscapes of mature epicardial cells | Journal of Pharmaceutical Analysis | 8.8 | 2023 | 心脏 |
3 | High-resolution anatomical and spatial transcriptome analyses reveal two types of meristematic cell pools within the secondary vascular tissue of poplar stem |
MOLECULAR PLANT | 21.949 | 2023 | 杨树茎 |
4 | Clinical challenges of tissue preparation for spatial transcriptome |
Clinical and Translational Medicine | 8.554 | 2022 | 组织 |
5 | Single-cell and spatial analysis reveal interaction of FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in colorectal cancer |
Nature Communications | 17.694 | 2022 | 组织 |