在刚刚过去的2020年中,以DNA methylation为关键词在Pubmed中共能检索到6200篇文章。其中,IF>10的文章共计635篇,IF>20的共计105篇,IF>30的共计45篇。和前五年呈现出的显著递增趋势相比,2020年所发表文献的数量有明显下降,高分文献的占比有所减少,这和去年的新冠疫情影响应该有很大关系。
单细胞转录组技术实现对单个细胞进行详细的转录组分析,其在解析细胞异质性和鉴定新型细胞亚群层面具有独特的优势。现今,该技术已广泛应用于生物医学领域,比如解析肿瘤微环境细胞组成、哺乳动物胚胎发育等。
好不容易拿到了自己的空间转录组数据,心情激动、跃跃欲试,想赶快去实施一下自己的idea,可是又不会写代码,只能干等着?当然不是,其实你完全可以实现不写代码完成自己大部分数据挖掘的工作。
在胚胎发育过程中,造血干细胞(HSCs)需要迅速分化为成熟的血细胞。当前主要通过小鼠和体外模型系统来了解胎儿造血干/祖细胞(HSPCs)。研究表明在发育过程中,胎儿的造血功能包括不同器官中稀有造血干细胞的分化、迁移。人类确定性造血作用始于背主动脉造血簇中HSCs的出现,这些HSCs在4 PCW首先定位于胎儿肝脏并进行扩张,在10.5 PCW时,造血部位转移至骨髓并建立成人造血功能。
扎根于细胞生物学领域40余年,BD公司在流式和抗体领域占据着主导地位。作为目前单细胞研究常用的技术之一,BD公司2018年推出的Rhapsody™单细胞分析平台克服了传统检测的局限性,能够对上万个单细胞的数千个表达基因同时进行定量检测,鉴定和表征新型和罕见细胞类型,有助于理解从免疫学到肿瘤学等多个领域的生物学过程。
研究人员使用空间转录组测序技术(spatial transcriptome,ST)来识别,阻断肿瘤异质性的来源,提供识别新的生物标志物的能力,并深入了解肿瘤细胞、脂肪组织、血管、三级淋巴结构和TME间基质之间的动态相互作用。
过往研究报道了早期胎儿肠上皮细胞动力学与IBD之间的联系,提示IBD患者的肠上皮中可能重现了类似于胎儿的转录程序。因此,解读肠道发育是预防和治疗此类疾病的关键一步。
DNA甲基化标志物作为标志物的成功案例有MGMT启动子甲基化可预测胶质母细胞瘤和血浆中甲基化SEPTIN 9(SEPT9)检测无症状结直肠癌,这些都已被纳入临床指南并转化为商业化临床试验。