伯豪学院

6 月份单细胞测序相关文献共收集到 46 篇（IF>9），平均影响因子 21.595，文末列出文献发表期刊、研究方向和技术平台等信息，接下来看看其中 5 篇文章。

【标题】Notch 信号驱动滑膜成纤维细胞特性和关节炎病理
【平台】10X
【期刊】Nature（IF=42.778）
【时间】2020-06

【摘要】滑膜是一种围绕关节的间充质组织，主要由成纤维细胞组成，在类风湿关节炎中，滑膜组织经历明显的增生、发炎和浸润，并损伤关节。近期显示，亚层中的成纤维细胞亚群在类风湿性关节炎中大量的扩增，这与疾病活跃度有关。然而，这些成纤维细胞分化和扩展的分子机制尚不清楚。研究者确定 NOTCH3 信号在表达 THY1 的血管周围的和亚内层成纤维细胞分化中起关键作用并发现 NOTCH3 信号驱动成纤维细胞的转录及自从血管内皮细胞向外方向的空间梯度分布。在活动性类风湿关节炎中，滑膜成纤维细胞中的 NOTCH3 和 Notch 靶基因明显上调。在小鼠中，敲除 Notch3 基因或使用抗体阻断 NOTCH3 信号能够缓解炎症，防止炎症性关节炎的关节损伤。这些结果表明滑膜成纤维细胞的位置特性（positional identity）受到内皮细胞来源的 Notch 信号调节，而这种由基质间的信号互作正是炎症性关节炎中的炎症来源和病理学基础。

【标题】利用多能干细胞制造人类皮肤

【期刊】Nature（IF=42.778）

【平台】10X

【时间】2020.06

【摘要】整个皮肤系统由皮肤和它的各种附属结构（如毛囊、汗腺和指甲）组成，对于体温调节、体液保持、外部压力的抵御、触觉和痛觉的调节等多种过程至关重要。在体外培养和生物工程移植物中重建携带附属结构的人类皮肤仍然是一项亟待解决的生物医学难题。此研究报道了类器官体培养系统，该系统从人的多能干细胞中产生复杂的皮肤。研究人员使用转化生长因子 β（TGFβ）和成纤维细胞生长因子（FGF）信号途径的逐步调节，从而在球形细胞聚集体中诱导出颅上皮细胞和神经嵴细胞。在 4 到 5 个月的培养中，研究人员观察到类似囊肿的皮肤类器官体出现，该类器官体由分层的表皮、富含脂肪的真皮以及有皮脂腺的色素性毛囊组成。感觉神经元和雪旺氏细胞网络形成神经样束，以类器官体毛囊中的默克尔细胞为靶标，模仿与人类触摸相关的神经回路。单细胞 RNA 测序和与胎儿标本的直接比较表明，在发育的中期，皮肤类器官体与人类胎儿的面部皮肤相同。此外，研究者表明，皮肤类器官体被移植到裸鼠上时会形成平坦的有毛皮肤。总之，这些结果表明，几乎完整的皮肤可以在体外自我组装，并可以在体内重建皮肤。研究者预计这一皮肤类器官体将为人类皮肤发育、疾病建模和重建手术奠定基础。

【标题】肿瘤免疫治疗诱导结肠炎症的分子途径

【期刊】Cell (IF=38.637)

【时间】2020-06-25

【摘要】研究显示，用 PD- 1 和 CTLA- 4 抑制受体的特异性抗体阻断检查点，可以在多种人类癌症中诱发持久的反应。然而，至今为止，我们对于负责严重炎症副作用的免疫学机制仍然知之甚少。此研究报告了结肠炎中免疫细胞群的全面单细胞分析，结肠炎是检查点阻断的常见和严重的副作用。研究者观察到具有高度细胞毒性和增殖状态的 CD8 T 细胞的惊人积累，而没有调节性 T 细胞耗竭的证据。T 细胞受体（TCR）序列分析表明，结肠炎相关的 CD8 T 细胞有相当一部分来源于组织驻留的细胞，这解释了治疗开始后结肠炎症状经常提前出现的原因。研究分析还发现了细胞因子、趋化因子和表面受体，它们可以作为结肠炎和检查点阻断的其他潜在炎症副作用的治疗靶点。

【标题】COVID-19 严重程度与气道上皮 - 免疫细胞相互作用相关

【平台】10X

【期刊】Nat Biotechnol (IF=36.558)

【时间】2020.06.26

【摘要】为了研究与 2019 严重冠状病毒病（COVID-19）相关的免疫应答和机制，研究者对 19 名临床特征明确的中度或重症患者以及五个健康对照的鼻咽和支气管样本进行了单细胞 RNA 测序。研究人员确定了易受严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2（SARS-CoV-2）感染的气道上皮细胞的类型和状态。在患有 COVID-19 的病人中，上皮细胞的 SARS-CoV- 2 受体 ACE2 的表达平均增加了三倍，这与免疫细胞的干扰素信号相关。与中度病例相比，危重病例表现出的上皮细胞与免疫细胞之间的相互作用更强，比如配体 - 受体表达谱和活化的免疫细胞，这其中包括表达 CCL2、CCL3、CCL20、CXCL1、CXCL3、CXCL10、IL8、IL1B 以 TNF 的炎性巨噬细胞。与中度病例相比，危重病例的转录差异可能促进了临床观察到炎性组织损伤、肺损伤和呼吸衰竭加剧。这些数据表明，CCR1 和 / 或 CCR5 途径的药理抑制作用可能会抑制重症 COVID-19 中的免疫过度活化。