宏转录组测序，可原位研究特定生境特定时空下微生物群落中活跃菌种的组成以及活性基因的表达情况。结合理化因素的检测，宏转录组可研究多样本间由于理化等指标的差异，时空上不同微生物群落间活跃成分组成的差异分析。
物种：DNA、粪便、土壤、水体、其它；
RNA 处理方式：rRNA 去除；
测序方式：PE150。
样品 RNA 抽提、质检经验丰富。
1、宿主基因组比对（去除宿主 RNA 及 rRNA 序列）；
2、De novo 序列拼接；
3、UniGene 表达定量；
4、UniGene 比对数据库（物种分类）；
5、物种丰度分析。
