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Pathway-Network

Demo 结果

本图表达了显著性 pathway 之间的关系

Demo 结果解读

图中表明了显著性 pathway 之间的关系以及发现受实验影响的核心 Pathway。

信号通路调控网络构建(Pathway-Network)介绍

根据所有差异基因同时参与的 Pathway 之间的相互调控关系构建信号通路调控网络,从系统的角度研究各个信号通路间的信号传导和调控过程,在多个显著性 Pathway 中发现受实验影响的核心 Pathway, 以及实验影响的信号通路之间的调控机理。

分析要求

KEGG 富集分析的结果或者感兴趣的 KEGG 中的 pathway(pathway 个数大于 10)。

提供结果

图片文件(Network 图),包括 png,PDF 格式;

Cytocape 文件:可以 cytoscape 打开进行细节调整;

文本文件:pathway 之间的关系以及每个 pathway 对应的 indegree,outdegree。

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