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-ceRNA调控网络

Demo结果

 

Demo结果解读

通过展示不同基因的ceRNA的调控机制,从中挖掘出实验组与对照组不同类型的ceRNA机制,找到特异性的ceRNA。线代表不同的microRNA,蓝色为mRNA,红色为circRNA,绿色为lncRNA。

 

ceRNA调控网络介绍

建立了一个计算的机制来使circRNA(lncRNA)作为ceRNA来保护mRNA不受miRNA的降解。基于基因的表达值,通过回归模型分析以及种子序列的匹配的方法,建立microRNA的海绵吸附作用的调控网络。

 

分析要求

  1. 客户需要提供microRNA表达数据(可选),circRNA(lncRNA)表达数据(必选),mRNA表达数据(必选);
  2. 每组数据3个或3个以上生物学重复。

 

提供结果

  1. 图片文件(Network图),包括png、PDF格式;
  2. Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;
  3. 文本文件:基因之间ceRNA调控关系,调控分数,circRNA(lncRNA)microRNA,mRNA核心调控关系的排序。