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-信号通路调控网络构建(Pathway-Network)

Demo结果

 

Demo结果解读

图中表明了显著性pathway之间的关系以及发现受实验影响的核心Pathway。

 

信号通路调控网络构建(Pathway-Network)介绍

根据所有差异基因同时参与的Pathway之间的相互调控关系构建信号通路调控网络,从系统的角度研究各个信号通路间的信号传导和调控过程,在多个显著性Pathway中发现受实验影响的核心Pathway,以及实验影响的信号通路之间的调控机理。

 

分析要求

KEGG富集分析的结果或者感兴趣的KEGG中的pathway(pathway个数大于10)。

 

提供结果

  1. 图片文件(Network图),包括png,PDF格式;
  2. Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;
  3. 文本文件:pathway之间的关系以及每个pathway对应的indegree,outdegree。