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相互作用研究和验证

背景介绍

在细胞的复杂环境下,存在着大量的相互作用。有核酸与蛋白之间的,如转录因子与DNA的结合,RNP(Ribonucleoprotein)复合物中的蛋白与RNA的结合。有蛋白与蛋白之间的,如信号通路中的各个蛋白的相互作用。还有核酸与核酸之间的,如lncRNA对miRNA的sponge(海绵吸附)结合,miRNA对mRNA靶点的攻击。
阐述某基因的功能机制,则必须说明其DNA,或转录的RNA,或翻译的蛋白,与别的分子如何相互作用。此时,需要用到相互作用的研究方法,包括:Pulldown,Co-IP(Co-Immunoprecipitation,免疫共沉淀),RIP(RNP-Immunoprecipitation),ChIP(Chromatin Immunoprecipitation),双荧光素酶报告系统实验。



有时,基因的转录的RNA,或翻译的蛋白,其细胞定位也是很重要的信息,可预判其功能。此时,可采用FISH(Fluorescence In Situ Hybridization, 荧光原位杂交)来定位蛋白,RNA-FISH(RNA荧光原位杂交)来定位RNA。
 
RNA-FISH。A,RNA定位在线粒体中;B,RNA定位在细胞质中;C,RNA定位在细胞核中

技术流程





服务形式
客户提供基因信息,疾病信息,活细胞或细胞类型、培养条件信息,及需要做的实验类型。
公司提供实验报告(材料、试剂、仪器、方法、实验结果、数据分析)。

经典文献:
Leucci E et al., Melanoma addiction to the long non-coding RNA SAMMSON. Nature. 2016 Mar 24;531(7595):518-22.