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表观组-甲基化DNA免疫共沉淀

甲基化DNA 免疫共沉淀测序(MeDIP-seq)技术简介

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing),即甲基化DNA 免疫共沉淀测序。先用5′-甲基胞嘧啶抗体富集胞嘧啶甲基化的基因组片断,然后对富集的片段进行高通量测序。该方法检测范围覆盖全基因组,所需测序数据量较少,但不能在单碱基分辨率水平上检测DNA胞嘧啶甲基化状态。

 

伯豪特色

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  2. 质控过程全程可溯,实时跟踪,反馈及时,确保数据真实可靠。
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实验流程


技术路线


测序策略

  • PE150,40M reads  6G数据量

 

样品需求(基因组DNA)

  1. 样品纯度:OD 260/280值应在1.8~2.0 之间;RNA 应去除干净。
  2. 样品浓度:浓度不低于50ng/ul。
  3. 样品总量:每个样品总量不少于1.5ug。
  4. 样品溶剂:溶解在H20或TE (pH 8.0)中。
  5. 样品运输: DNA低温运输(-20℃);且在运输过程中请用parafilm将管口密封好,以防出现污染。
数据分析展示