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转录组-基于Luminex 200系统的QGP核酸多重检测

基于Luminex 200系统的QGP核酸多重检测介绍

QuantiGene® 2.0 高通量核酸定量研究系列产品是世界知名基因芯片制造商Affymetrix 公司旗下Panomics的畅销产品。QuantiGene® Plex除了利用xMAP技术外,还整合了西门子授权并经过临床验证的branched DNA(bDNA)技术,该技术可用于Versant HIV、HBV以及HCV的病毒载量分析,通过信号放大技术,而非模板放大,bDNA技术实现了对模板的直接定量检测。
QuantiGene® Plex是验证表达谱芯片和二代测序数据、DNA拷贝数检测、临床FFPE样本和血液样本的多基因检测、信号传导通路检测以及转化研究中生物标志物与药物靶点验证研究等的理想工具。

 

技术特点

  1. 多重定量:96孔板,80个样本/板,单孔同时定量检测多达80个目标基因;当样本数与基因数较多时,性价比高于定量PCR;
  2. 可测定不同类型的样本:培养细胞、血液或组织(新鲜、冰冻或福尔马林固定、石蜡包埋 FFPE等);
  3. 无需抽提纯化RNA或DNA,仅需少量固体或液体样本;
  4. 无需反转录RNA;
  5. 无需PCR扩增,避免引入误差;
  6. 简化的工作流程。

 

实验流程

 

服务推荐

  1. 单基因表达定量服务:Affymetrix-Panomics QuantiGene® 2.0 Assay
  2. 多重基因表达定量服务:Affymetrix-Panomics QuantiGene® Plex 2.0 Assay
  3. DNA拷贝数测定服务:Affymetrix-Panomics QuantiGene® Plex DNA Assay
    预设计探针组:Affymetrix已经开发了庞大的已验证基因的探针库,超过1600种探针组,包括超过15000个基因。预设计探针组覆盖了广泛的物种,包括:人类、小鼠、大鼠、犬类、猴、猪、大豆和玉米等诸多物种,任何现有基因的组合都可以整合设计新的探针组,要了解更全面探针组和基因信息,可访问www.panomics.com或者联系我们。
    定制探针组:Affymetrix可针对任何基因以及任何物种提供定制探针服务。定制分析组合为3-80 plex(RNA)和3-33 plex(DNA)。客户只需提供基因列表、参考序列ID或者DNA序列,即可在两周内完成设计。

 

仪器平台

  • Luminex 200液相芯片分析系统

 

案例分析

mRNA靶标验证

使用Affymetrix GeneChip® Arrays对炎症通路激活的特征基因表达进行鉴定。继而通过使用QuantiGene Plex(QGP)和qPCR分析对经LPS处理的小鼠样本进行测试以进一步验证该特征。收集52只处理后和未处理的小鼠脾脏,制备组织裂解物进行QGP分析,或同时纯化RNA进行qPCR测试。处理后,QGP和qPCR分析均显示出类似的上调或下调模式。但是相比于qPCR,QGP分析可提供更准确和精密的结果。在本研究中,必须处理14块qPCR反应板才能获得一块QGP反应板相当的信息。

原文:Ebsworth K. Gene expression analysis by Quantigene Plex: validation and applications. Planet xMAP USA; 2007 March 12-14; Laguna Hills, CA