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单细胞测序平台

单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing)是指在单细胞水平上对RNA进行高通量测序和分析的新技术。不同于常规Bulk Sequencing(组织或细胞群测序)得到的结果只是大量细胞的平均表达水平,单细胞测序能够深入挖掘细胞特异性的信息。目前,单细胞测序已广泛应用于肿瘤异质性、免疫微环境、神经科学、胚胎发育、细胞分化等领域的研究。

伯豪生物拥有单细胞测序的主流平台——BD Rhapsody,10 X genomics。将为客户提供更大规模、更加灵活、更为全面的单细胞测序服务。


伯豪生物经过6年的积累,建立了包括 SMART-seq,10X Genomics BD Rhapsody 的单细胞RNA测序平台,为客户提供从样本保存、运输、单细胞悬液制备,到单细胞分选、建库和数据分析的一站式解决方案。目前已为来源于人、小鼠、大鼠、果蝇、斑马鱼、牛、羊等物种的临床和科研样本提供了单细胞测序和数据分析服务,研究成果发表在 Cell Research、Nature Neuroscience 等杂志上。伯豪生物将不断完善技术方法和服务体系,助力客户发表高水平研究论文。

伯豪生物单细胞测序平台仪器设备展示

 

伯豪生物单细胞测序优势与实验流程展示

 

应用范围


●肿瘤异质性

Kim C, Gao R, Sei E, et al. Chemoresistance Evolution in Triple-Negative Breast Cancer Delineated by Single-Cell Sequencing. Cell 2018, 173(4):879-893.

肿瘤免疫微环境

Zheng C, Zheng L, Yoo JK, et al. Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing. Cell 2017, 169(7):1342-1356.

神经科学

Li CL, Li KC, Wu D, et al. Somatosensory neuron types identified by high-coverage single-cell RNA-sequencing and functional heterogeneity. Cell Res 2015, 26(1):83-102.

胚胎发育

Li L, Dong J, Yan L, et al. Single-Cell RNA-Seq Analysis Maps Development of Human Germline Cells and Gonadal Niche Interactions. Cell Stem Cell 2017, 20(6):858-873

●细胞分化

Bach K, Pensa S, Grzelak M, et al. Differentiation dynamics of mammary epithelial cells revealed by single-cell RNA sequencing. Nat Commun 2017, 8(1):2128.

 

 

 消除批次间差异

细胞亚群聚类化及可视化

细胞亚群注释

单细胞测序不同cluster转录本表达丰度分布统计与不同cluster 细胞数目统计

Marker基因分析

拟时序分析


拟时序GO功能注释
拟时序分化转录因子调控网络

患者之间的功能特征性差异分析
 

伯豪生物单细胞测序活动