技术服务热线:800-820-5086 | 400-880-5086 登录 | 注册 ENGLISH

【伯豪生物】8月影响因子破7000,成功的关键在于......

2019-09-02点击83次
分享:

小编精选了8月份客户的文章,给大家提供些科研灵感。


NO:1

发布期刊:Nat Commun(IF:11.9)

题目:circTP63 functions as a ceRNA to promote lung squamous cell carcinoma progression by upregulating FOXM1.

伯豪生物产品:ceRNA芯片

关键词:肺鳞癌,ceRNA,FOXM1,细胞周期

摘要:

        环状RNA (circRNAs)被认为是多种癌症的重要调控因子。然而,circRNA在肺鳞状细胞癌(LUSC)中的作用尚不清楚。在此,作者使用ceRNA芯片检测了了5对LUSC样品中circRNA和mRNA的表达谱。通过分析差异表达的circRNA和mRNA的共表达网络,发现与调节细胞周期相关的circRNA,circTP63,在LUSC组织中上调,其上调与LUSC患者肿瘤体积较大、TNM分期较高有关。circTP63的表达升高促进了细胞在体内和体外的增殖。从机理上讲,circTP63与FOXM1共享miRNA反应元件。circTP63竞争性地与miR-873-3p结合,阻止miR-873-3p降低FOXM1表达水平,从而上调CENPA和CENPB,最终推动细胞周期进展。




NO:2

发布期刊:Genome Res(IF:9.9)

题目:Profiling the long noncoding RNA interaction network in the regulatory elements of target genes by chromatin in situ reverse transcription sequencing.

伯豪生物产品:RNA测序

关键词:长链非编码RNA,染色质相互作用,启动子,多能性,重编程,Sox2, Pou5f1

摘要:

        长链非编码RNA(lncRNAs)通过参与染色质结构的构建,调控靶基因的活性。该研究通过“染色体-RNA原位逆转录测序”,(CRIST-seq)将RNA生物素标记的简便性与CRISPR/Cas9的特异性相结合,分析lncRNA在基因调控元件中的互作网络。利用基因特异性gRNAs,该研究发现了维持多潜能所必需的两个关键干细胞因子,Sox2和Pou5f1,启动子中一个多潜能特异性lncRNA相互作用网络。与启动子相互作用的lncRNA在重编程成多能性的过程中被特异性激活。这些lncRNA的下调导致干细胞多能性的消失。相反,多潜能相关lncRNA的过表达激活了干细胞核心因子基因的启动子,增强了成纤维细胞向多能性重编程。这些CRIST-seq数据表明,Sox2和Pou5f1启动子被控制在一个特殊的lncRNA相互作用网络中,该网络决定了重编程过程中多能性的命运。这种CRIST方法可广泛应用于绘制整个基因组目标位点的lncRNA相互作用网络。




NO:3


发布期刊:Clin Cancer Res

题目:Genetic aberrations in the CDK4 pathway are associated with innate resistance to PD-1 blockade in Chinese patients with non-cutaneous melanoma.

伯豪生物产品:RNA测序

关键词:PD-1,黑色素瘤,CDK4,耐药,联合用药
摘要:

        PD-1检查点阻断免疫治疗可诱导晚期黑色素瘤患者产生长期、持久的反应。然而,只有一小部分黑色素瘤患者受益于这种方法。抗PD-1治疗的耐药机制尚不清楚。对抗PD-1抗体治疗晚期黑色素瘤患者队列(n=31)的基线肿瘤活检组织进行全外显子组测序(WES)和RNA测序(RNA- seq)分析。在验证队列(n=85)中,使用TaqMan基因拷贝数分析对CDK4、CCND1和CDKN2A基因拷贝数变异(CNV)进行了分析。在PD-1人源化小鼠(C57BL/6-hPD-1)和人源化免疫系统(HIS)患者异种移植(PDX)模型中,评价了CDK4/6抑制剂联合抗PD-1抗体单一药物治疗的效果。WES结果显示,在无临床获益队列的患者中,有几个显著的基因拷贝数增加,如CDK4的12q14.1位点。85例黑色素瘤患者证实了CDK4拷贝数的增加与先天性抗PD-1治疗耐药之间有相关性(P<0.05)。RNA-Seq分析的CDK4-normal细胞系和CDK4-normal肿瘤结果表明,通过NF-κB、炎症反应和干扰素-γ反应基因组,TNF-α信号的转录输出发生改变。此外,CDK4/6抑制剂(palbociclib)治疗增加了C57BL / 6-hPD-1黑色素瘤细胞和HIS PDX模型中PD-L1蛋白质含量,也增强了的疗效(P < 0.05)。总之,研究发现CDK4通路的基因变异与晚期黑色素瘤患者抗PD -1治疗的先天耐药性有关。此外,本研究为CDK4/6抑制剂与抗PD-1抗体联合治疗晚期黑色素瘤提供了强有力的理论依据。




NO:4

发布期刊:Cancer Immunol Res

题目:Blockade of Immune Checkpoint B7-H4 and Lysine Demethylase 5B in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Confers Protective Immunity against P. gingivalis Infection.

伯豪生物产品:RNA测序

关键词:食管鳞癌,Porphyromonas gingivalis,宿主免疫力,B7-H4,组蛋白去甲基酶赖氨酸去甲基酶5B,淋巴细胞浸润
摘要:

        病原体能够劫持免疫防御机制,从而为感染部位内出现的高突变恶性细胞创造一个耐受环境。以免疫检查点为导向的免疫疗法已显示出相当大的前景。同样重要的是,免疫逃避表型的表观遗传重编程能够以协同方式激活免疫系统,从而改善免疫治疗结果。这些进展导致了表观遗传学和免疫疗法的结合。之前研究已经证明牙龈卟啉单胞菌是从食管鳞癌(ESCC)中分离出来的,它是这种致命疾病的主要病原体。在这项研究中,调查了牙龈假单胞菌感染期间与宿主免疫有关的机制,实验感染的ESCC会增加B7-H4和赖氨酸去甲基酶5B的表达,这使得后续在慢性感染和异种移植人肿瘤免疫模型体内分析抗-B7-H4和组蛋白脱甲基酶抑制剂的免疫治疗效果成为可能。在三只接受联合治疗的临床前小鼠模型中,发现小鼠对牙龈假单胞菌感染和肿瘤发生具有较强的抵抗力。这可能是通过在微环境中产生T细胞介导的反应和形成免疫记忆而发生的。在ESCC受试者中,B7-H4和KDM5B的共表达与细菌负荷的相关性比单独表达两种分子更显著。这些结果突出了牙龈假单胞菌感染菌逃避免疫的独特能力,并确定了可用于治疗的潜在靶点,以改善牙龈假单胞菌感染的控制和肿瘤的形成。




NO:5
发布期刊:New Phytol

题目:Brassinosteroid regulation of wood formation in poplar.

伯豪生物产品:RNA测序

关键词:杨树,油菜素甾醇,林木,激素,次生生长,木材形成

摘要:

        油菜素甾醇与草本植物维管细胞类型的分化有关,但其在次生生长和木材形成过程中的作用尚不明确。本研究用药理学和基因组层面的方法操控油菜素甾醇水平,并测定对茎的次生生长和木材形成以及基因表达的影响。油菜素甾醇水平的提高可导致次生生长和受拉木形成的增加,而油菜素甾醇合成的抑制导致生长减缓和次生维管组织分化。基因表达分析表明,油菜素甾醇的作用与参与细胞分化和细胞壁生物合成的基因正相关。显示结果表明,油菜素甾醇在调节次生生长和木材形成中发挥了基础作用,部分是通过细胞分化和次生细胞壁的合成来实现。


        有了灵感和方向之后,科学的研究体系和工作量也是必须的。国自然刚刚揭榜,获得充裕经费的您欢迎和我们公司合作项目,创造有价值的科研成果;或者您要申请2020年的国自然,那么抓紧在我们这里做些前期研究基础,提高您的申请成功率。协助客户累积达到7000分的影响因子代表着我们值得信赖的经验和认真服务的态度!


原文链接: 【伯豪生物官方微信】←点击跳转