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【伯豪生物】高效!7月平均2天协助一篇SCI文章!

2019-09-02点击69次
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这里,小编精选了一些文章和大家分享:


—— 01 ——


发表期刊:Theranostics(IF:8.1)

题目:Circular RNAs negatively regulate cancer stem cells by physically binding FMRP against CCAR1 complex in hepatocellular carcinoma.
伯豪生物产品:RNA测序
关键词:RNA结合蛋白;癌症干细胞;circular RNA;肝细胞癌


摘要:

circRNA在多种癌症的临床前诊断和治疗中都有巨大的应用潜力。据报道,它在恶性肿瘤的多个生物学行为中都发挥过作用,包括增殖、迁移、转移和耐药。然而,circRNA与癌症干细胞(CSCs)之间的潜在相关性还未有报道。运用组织芯片检测肝细胞癌(HCC)组织中circZKSCAN1的表达水平,以明确其预后价值。运用功能缺失和获得实验来研究circZKSCAN1在HCC 干性中的作用。利用生物信息学分析预测可能的下游RNA结合蛋白,并进一步通过RNA免疫沉淀测序(RIP-seq),鉴定RBP调节基因。结果发现circZKSCAN1的缺失会造成多种恶性特性,包括肿瘤干性,并且还密切影响了HCC 的总体生存率和无复发生存率。生物信息学分析和RIP-seq结果显示,circZKSCAN通过竞争性结合FMRP,进而阻碍了FMRP和β-catenin结合蛋白-细胞周期及凋亡调节因子1(CCAR1)之间的结合,随后抑制Wnt信号传导的转录活性。此外,在HCC组织中RNA剪切蛋白Quaking 5下调,并和circZKSCAN1的下调有关。综上,该研究揭示了circZKSCAN1在HCC CSCs中的调节作用机制,并认为新发现的Qki5-circZKSCAN1-FMRP-CCAR1-Wnt 信号通路可能成为HCC治疗潜在的重要靶点。


—— 02 ——

发表期刊:Oncogene(IF:6.6)
题目:Hsa_circ_101555 functions as a competing endogenous RNA of miR-597-5p to promote colorectal cancer progression.
伯豪生物产品:表达谱芯片
关键词:circular RNA;结直肠癌;miR-597-5p;预后


摘要:

circRNAs在调节结直肠癌(CRC)的病理生理过程和指导临床诊治方面具有重要作用。然而,仍有许多CRC相关circRNA有待进一步挖掘。在该研究中,研究人员通过芯片对10例CRC组织及相应正常组织(NATs)中的circRNAs表达谱进行了检测,发现肿瘤组织中hsa_circ_101555 (circ101555)的表达显著上调,且与CRC患者的预后密切相关。circ101555由宿主基因CSNK1G1反向剪接产生,具有特异性闭环结构,显示出比线性RNA更高的稳定性。体内外实验结果表明,抑制circ101555的表达可以显著抑制细胞增殖,诱导细胞凋亡,损害CRC细胞的DNA修复能力,而挽救实验结果表明,下调miR-597-5p表达可显著减弱circ101555敲低对CRC细胞的生物学效应。双赢原位杂交(D-FISH)分析、RIP分析和生物素偶联探针pull down实验证实circ101555可能作为miR-597-5p的海绵吸附体,有效富集miR-597-5p。此外,致癌基因CDK6和RPA3被确定为是miR-597-5p的靶基因。该研究结果表明circ101555可能作为miR-597-5p的竞争性内源RNA,在CRC中上调CDK6和RPA3的表达,从而促进CRC进展。该研究结果提示circ101555可作为判断结直肠癌患者预后的有效指标,而沉默circ101555可作为结直肠癌治疗的有效措施。


—— 03 ——


发表期刊:RNA Biology(IF:5.5)

题目:Circular RNA profile of parathyroid neoplasms: analysis of co-expression networks of circular RNAs and mRNAs.
伯豪生物产品:ceRNA芯片
关键词:CDC73;甲状旁腺癌;Circular RNA;co-expression网络;mRNA


摘要:

circRNA是近年来发现的一类参与多种生物学过程和肿瘤进展的非编码RNA。然而,circRNA在甲状旁腺肿瘤中的表达模式仍不清楚。利用芯片技术对6例甲状旁腺癌(PCs)、6例甲状旁腺腺瘤(PAs)和4例正常甲状旁腺组织的circRNA表达谱进行了检测,并运用生物信息学技术进行共表达网络分析以求找到潜在的核心circRNA。采用RT-qPCR和荧光原位杂交技术(FISH)对甲状旁腺肿瘤中circRNA及mRNA的表达进行了验证。与正常甲状旁腺相比,PC和PA组织中分别有5310和1055个circRNA差异表达。RT-qPCR检测了4种circRNA (hsa_circRNA_0035563 (p = 0.006)、hsa_circRNA_0017545 (p = 0.009)、hsa_circRNA_0001687 (p = 0.005)、hsa_circRNA_0075005 (p = 0.001)、4种mRNA (MYC、FSCN1、ANXA2、AKR1C3)在PC和PA组织中的差异表达。hsa_circ_0035563的高表达与PC患者CDC73突变(p = 0.022)及复发(p = 0.042)相关。使用FISH实验发现hsa_circ_0075005可以帮助区分PCs与良性病变,曲线下面积为0.779 (p = 0.013)。该研究结果首次描述了PC的circRNA表达谱,并表明circRNA和mRNA在甲状旁腺肿瘤发生过程中相互作用,结果表明hsa_circ_0075005和MYC可用于PC和PA的鉴别诊断。hsa_circ_0035563的表达水平与恶性肿瘤中CDC73的突变及复发有关,提示该指标在PC患者预后中的意义。



—— 04 ——


发表期刊:Clin Sci (Lond)(IF:5.2)
题目:MicroRNA-302d promotes the proliferation of human pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes by inhibiting LATS2 in the Hippo pathway.
伯豪生物产品:RNA测序
关键词:Hippo 通路; 心肌细胞; 人类多能干细胞; miR-302/367集群; miR-302d


摘要:

有报道称心肌细胞(CMs)在心肌梗死(MI)后可以低水平增殖,但尚不足以重建心脏功能。有一些miRNA已经被证明能充分诱导啮齿类动物CM增殖。然而,由于miRNA在物种间的保守性较差,在啮齿类动物中发现的miRNA是否能够促进人类CM增殖尚不清楚。该研究得到以下结论:1)从第4天到第18天,在人类多能干细胞(hPSCs)的CM分化过程中,microRNA-302d (miR-302d)表达显著下降;2)miR-302d有效促进hPSC-derived CM的增殖;3)miR-302d通过靶向Hippo通路中的LATS2促进CM增殖;4)RNA测序分析表明,miR-302d过表达可以引起与细胞周期相关基因的差异表达。该研究为miR-302d的治疗潜力提供了进一步的证据。




—— 05  ——


发表期刊:Environ Microbiol(IF:5.1)
题目:Spontaneous mutations in FgSAD1 suppress the growth defect of the Fgprp4 mutant by affecting tri-snRNP stability and its docking in Fusarium graminearum.
伯豪生物产品:RNA测序
关键词:镰刀菌;Fgprp4突变体;FgSAD1;tri-snRNP


摘要:

FgPrp4是剪接体中唯一的激酶,对于活力不是必需的,但对于禾谷镰刀菌的剪接效率很重要。FGPRP4缺失突变体有严重的生长缺陷,但常产生生长速度较快的自发抑制因子。为了更好地理解抑制机制,我们鉴定了tri-snRNP特异性蛋白FgSad1的自发突变体,该突变体可以抑制Fgprp4缺失而导致的生长缺陷。L512P突变被证实对Fgprp4的功能具有抑制作用,这表明FgSad1突变可能影响Fgprp4对FgSad1的磷酸化。磷蛋白组学分析表明,fgsad1可能不是fgprp4激酶的直接底物。此外,序列分析显示FgSad1的N末端,额外的富含RS的区域对其功能是关键的并且是翻译后修饰的。FgSad1中P258S或S269P突变增加了其与U5蛋白FgPrp8和U4/U6蛋白FgPrp31的相互作用,这可能导致tri-snRNP的稳定化。此外,D76N突变增加了FgSad1与U2 snRNP的关联。该研究表明,FgSad1中的抑制基因突变增加了tri-snRNP的稳定性和/或FgSad1与U2 snRNP的亲和力,因此可能促进tri-snRNP与剪接体的对接。


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