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2019年5月伯豪客户最新高分文章解读

2019-06-20点击366次
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IEEE下令清理华为系审稿人事件震惊了学术界,大家纷纷感慨知识无国界是个伪命题。由此可见,发展自己的学术刊物也是维护学术发声权的必要保障呐。

其实中国的SCI期刊数是全球第五位,总数达到197,总量上是十分可观的,而质量也在不断前进。下面来小编就盘点一下生命科学领域优秀的中国SCI期刊:

  • Cell Research (IF: 15.4)
  • Fungal Diversity (IF: 14.1)
  • Bone Research (IF: 12.4)
  • National Science Review (IF: 9.4)
  • Molecular Plant (IF: 9.3)
  • Cellular & Molecular Immunology (IF: 7.6)
  • Protein & cell (IF: 6.2)
  • Journal of Molecular Cell Biology (IF: 5.6)

总体而言,中国SCI期刊的质量也在不断上升,高引量SCI不在少数,这无疑归功于默默在科研岗位上辛勤耕耘的专家学者。中国的SCI论文数占全球第二,工作量之大可想而知,后面发展相信更加会抓质量,相信以后中国的科研圈也会越来越好。

无论外界的形势如何变化,发展好自己才能有效的行动,比如脚踏实地为科研事业真诚付出的伯豪生物。

五月伯豪生物协助客户发表文章13篇,累积影响因子达54.7分,涉及了多个科研方向,比如ceRNA、表观遗传、微生物、GWAS等等。小编精选了每个方向的文章,我们来看看研究思路吧。

Part 1

发表刊物:Nat Commun
题目:Lnc-TALC promotes O6-methylguanine-DNA methyltransferase expression via regulating the c-Met pathway by competitively binding with miR-20b-3p.
方向:ceRNA
伯豪生物产品:ceRNA芯片
关键词:lncRNA;胶质母细胞瘤;替莫唑胺;化疗耐药
长链非编码RNA(lncRNA)作为新型调节分子已经被证实参与了多种生命调节过程,包括治疗抗性的产生。然而,lncRNA在胶质母细胞瘤(GBM)的替莫唑胺(TMZ)耐药机制中所起的作用尚不可知。为了解lncRNA在TMZ耐药机制中所扮演的角色,研究里诱导产生了TMZ耐药性GBM细胞,并对亲本和TMZ耐药性GBM细胞进行lncRNA芯片分析,在TMZ耐药性GBM细胞中发现了新的lncRNA,lnc-TALC(与胶质母细胞瘤替莫唑胺耐药相关),它通过竞争性地结合miR-20b-3p,促进c-Met的表达,且磷酸化的AKT / FOXO3能够调节TMZ耐药性GBM细胞中的lnc-TALC表达。此外,研究发现lnc-TALC可以通过c-Met / Stat3 / p300介导MGMT启动子区H3K9,H3K27和H3K36的乙酰化,进而增强MGMT的表达。进一步研究发现lnc-TALC是GBM患者产生TMZ耐药性和GBM复发所必需的。该研究结果表明, lnc-TALC可以作为TMZ耐药GBM患者的治疗靶点,从而提高TMZ化疗的临床疗效。


Part 2

发表刊物:Theranostics
题目:Therapeutic Targeting of BRD4 in Head Neck Squamous Cell Carcinoma.
伯豪生物产品:表达谱芯片
关键词:BRD4;溴结构域和额外终端域;JQ1;头颈部鳞状细胞癌
溴结构域和额外终端域家族成员是表观识别和转录共激活因子,它们涉及各种生物学过程,包括肿瘤的发生。BRD4作为关键致癌基因和抗癌靶点,它的关注度也是与日俱增。本文深入探究了HNSCC中BRD4的表达模式,以及其致瘤作用与靶向治疗。在原发性HNSCC样品和4NQO诱导的HNSCC模型中均发现BRD4的表达显著上调。BRD4的过表达与侵袭性临床病理特征,较差的总体生存率和无病生存率有密切相关性。敲除或药物抑制BRD4的表达会损害细胞增殖、迁移和侵袭,并降低体内肿瘤的生长和转移。对JQ1暴露后的HNSCC细胞进行转录组分析,发现了数百个可能介导抗肿瘤过程的基因,这些基因主要富集在癌症相关通路上,根据JQ1调节基因建立新的预后风险评分机制,可以将患者分为预后良好或较差的亚组。该研究结果发现BRD4是肿瘤发生的关键介质,同时也是HNSCC的重要预后标志物,对BRD4进行靶向治疗对于治疗HNSCC患者非常有意义。


Part 3

发表刊物:J Oral Microbiol
题目:Metatranscriptomic analysis of an in vitro biofilm model reveals strain-specific interactions among multiple bacterial species.
伯豪生物产品:RNA测序
关键词:生物膜;细菌相互作用;牙周微生物学;牙周病原体;牙周炎
细菌间的相互作用会影响生物膜的特性。该研究探究在体外牙龈下菌斑模型中,不同细菌引起功能失调的具体机制。16S rRNA和宏转录组测序结果表明,高毒力牙龈卟啉单胞菌W83对共生菌的影响大于低毒力牙龈卟啉单胞菌ATCC33277,并且中间普氏菌对W83的影响力具有易化作用。牙龈卟啉单胞菌显著影响口腔共生菌的代谢途径,并通过群体效应调控相关基因的表达。中间普氏菌与牙龈卟啉单胞菌W83发挥协同作用,但对菌株ATCC33277具有拮抗作用,中间普氏菌可能通过Clp蛋白调节牙龈卟啉单胞菌毒力因子的表达。互作网络表明,核梭杆菌和链球菌之间的相关性最强,这证明了它们在生物膜中的作用十分重要。具核梭杆菌的外膜蛋白相关的基因表达变化表明,添加不同的细菌可以干扰具核梭杆菌和其他菌之间的粘附性。这里报道了龈下菌斑中菌株特异性相互作用的存在,这些发现有助于增强我们对牙周病生物微环境的理解,对于牙菌斑的控制策略的制定提供了新的思路。


Part 4

发表刊物:J Viral Hepat
题目:Genetic variation in FCER1A predicts peginterferon alfa-2a-induced hepatitis B surface antigen clearance in East Asian patients with chronic hepatitis B.
伯豪生物产品:外显子芯片
关键词:慢性乙型肝炎;遗传变异;干扰素α-2a;响应
在一项多中心全基因组关联研究中,鉴定与成人慢性乙型肝炎患者治疗反应相关的宿主遗传因素,通过微阵列芯片分析获得1669例聚乙二醇干扰素α-2a持续给药≥24周(含/不含核苷类似物)患者的基因型数据。使用血清学和病毒学治疗终点来评估治疗24周后的效果。研究进行了36次单标记分析和基因-基因分析。在单标记分析发现没有单核苷酸多态性(SNP)位点达到全基因组显著性(P<5×10-8),但发现116个SNP位点存在潜在关联(P<1×10-5)。基因-基因分析发现基因FCER1A(rs7549785)在东亚患者中获得了乙型肝炎表面抗原(HBsAg)清除的全基因组显著性(P=2.65×10-8),具有中等效应(OR=4.74)。rs7549785的A等位基因的44个携带者中有11个(25%)实现了HBsAg清除,而非携带者为69/1051(7%)。FCER1A编码免疫球蛋白E受体的α亚基。在同源患者子集的事后分析中,rs7712322的基因内相关性最强(POLR3G, P=7.2110-7)。POLR3G编码聚合酶(RNA)III酶的G亚基,该基因参与感知和限制细胞内细菌和DNA病毒的感染,并可以作为先天免疫反应中的DNA传感器。分析显示,FCER1A(rs7549785)与成人慢性乙型肝炎患者的聚乙二醇干扰素α-2a反应相关,而且POLR3G可能也参与了该反应。


Part 5

发表刊物:J Gastroenterol Hepatol
题目:Epigenomic Profiling of DNA Methylation Reveals New Potential Biomarkers for Hepatocellular Carcinoma Diagnosis and Prognosis Prediction.
伯豪生物产品:甲基化芯片
关键词:DNA甲基化;全基因组分析;肝细胞癌;甲基化
DNA高甲基化已成为用于许多癌症的诊断和预后预测的新型分子生物标志物。本研究目标是确定HCC中由DNA甲基化调控的临床可用的生物标志物。在485577个CpG位点中,97027(20.0%)在HCC和非癌组织之间显著不同。在所有显著差异的CpG位点中,在HCC中48.8%是相对高甲基化,51.2%是低甲基化的。在HCC中确定了甲基化差异对应的基因参与了多种信号传导途径(AMPK,雌激素和脂肪细胞因子)。通过MSP和焦磷酸测序确认了FES的高甲基化,因此将对其做进一步分析。结果显示FES的高甲基化与肿瘤大小(0.001),血清AFP(0.023),肿瘤分化(0.006)都存在相关性。在51/100 (51%)HCC中FES蛋白显著下调,其中94.12%(48/51)是由于启动子高甲基化引起的。FES的高甲基化和FES蛋白的低表达都和HCC病人的PFS和OS相关。FES的过表达和敲降证实了其对HCC细胞增殖和迁移的抑制作用。该研究在HCC中鉴定了许多新的差异甲基化CpG位点,并证明FES在HCC中发挥着抑癌基因的作用,其甲基化状态可作为HCC预后的指标。

科研人都永远拥有着一颗赤子之心!伯豪生物也将秉持对科研服务工作赤诚之心,助力更多科学发现,为国家科技事业而奋斗!