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文献集锦│2021 年度 1 月 - 2 月 ceRNA 研究汇总
发布时间:2021-03-03 浏览次数:288
已知microRNA可以通过结合mRNA导致基因沉默,而ceRNA可以通过竞争性地结合microRNA来调节基因表达。ceRNA可以通过应答元件(microRNA response elements,MREs)与microRNA结合从而影响microRNA导致的基因沉默。

已知 microRNA 可以通过结合 mRNA 导致基因沉默,而 ceRNA 可以通过竞争性地结合 microRNA 来调节基因表达。ceRNA 可以通过应答元件(microRNA response elements,MREs) 与 microRNA 结合从而影响 microRNA 导致的基因沉默。如:miRNA 可通过抑制目的基因 mRNA 的翻译,或促进 mRNA 降解来起到负调控的作用,而另一些 RNA,如 circRNA,能够像海绵一样吸收、结合 miRNA,使其不能发挥负调控的作用,从而促进靶基因的表达。


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ceRNA 机制示意图

ceRNA 调控机制近年来一直是研究热点,2021 年 1 月~2 月 PubMed 上可检索到的文章就有 375 篇,其中超过 5 分的文章小编已经为大家整理好啦,详细信息见文末附表,让您不用再费时费力搜索,就能轻松获取最新的 ceRNA 机制研究成果和动态。小编挑出以下 5 篇作为重点分享内容。


文章展示

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标题:环状 RNA circSDHC 充当 miR-127-3p 的海绵,通过 CDKN3/ E2F1 轴促进肾细胞癌的增殖和转移

期刊:Mol Cancer.

影响因子:15.302

发表时间:2021.01.20

单位:中山大学附属第一医院

摘要:越来越多的证据表明,环状 RNA(circRNA)在癌症的发生和发展中起着重要的调节作用。但是 circRNA 在肾细胞癌(RCC)中的表达模式和生物学功能尚不清楚。该研究利用生物信息学方法筛选在 RCC 中差异表达的 circRNA,在线 circRNAs 芯片数据集和研究者自己的患者队列的分析表明,circSDHC(hsa_circ_0015004)在 RCC 中具有潜在的致癌作用。通过 qPCR 测量 RCC 组织和细胞系中的 circSDHC 表达,并评估 circSDHC 的预后价值;此外进行了一系列功能性体外和体内实验,以评估 circSDHC 对 RCC 增殖和转移的影响。RNA pull-down 测定,荧光素酶报告基因和荧光原位杂交测定确认 circSDHC,miR-127-3p 及其靶基因之间的相互作用。研究结果显示:临床上,circSDHC 的高表达与 RCC 患者的 TNM 分期晚期和生存不良有关。此外,circSDHC 在体内和体外均促进肿瘤细胞的增殖和侵袭,对 circSDHC 在 RCC 中作用的潜在机制的分析表明,它与 miR-127-3p 竞争性结合并阻止其抑制下游基因 CDKN3 和 E2F1 途径,从而导致 RCC 恶性进展。敲低 circSDHC 会导致 CDKN3 表达降低和 E2F1 途径抑制,这可以通过用 miR-127-3p 抑制剂来挽救。该研究数据首次表明 circSDHC/ miR-127-3p/ CDKN3/ E2F1 轴在 RCC 进展中起着至关重要的作用,因此 circSDHC 有望成为 RCC 患者的新治疗靶点。


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标题:三阴性乳腺癌中 CircNR3C2 通过海绵化 miR-513a-3p 促进 HRD1 介导的肿瘤抑制作用

期刊:Mol Cancer.

影响因子:15.302

发表时间:2021.02.02

单位:南京医科大学附属逸夫医院

摘要:E3 泛素连接酶 HRD1 在乳腺癌中被下调并起抑癌作用,而 HRD1 在不同乳腺癌亚型中的确切表达特征仍然未知。最近的研究表征了环状 RNA(circRNA)在肿瘤进展中起 miRNA 海绵的调控作用,为癌症相关基因的转录后调控提出了新观点。该研究使用公共芯片 / RNA 测序数据集和乳腺癌组织 / 细胞系检测 HRD1 蛋白和 mRNA 的表达。基于公共 RNA 测序结果,在线数据库和富集 / 聚类分析预测可能调节 HRD1 表达的 circRNA/miRNA 的关系对。体内和体外的功能获得性和挽救实验,评估 circNR3C2 通过 HRD1 介导的波形蛋白蛋白酶体降解对乳腺癌进展的抑制作用。HRD1 在三阴性乳腺癌(TNBC)中相对于其他亚型而言明显低表达,并且与波形蛋白呈负相关,通过诱导多聚泛素化作用抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭和 EMT(上皮间质转化)过程,介导的波形蛋白的蛋白酶体降解。在 TNBC 中,CircNR3C2(hsa_circ_0071127)也显著下调,与浸润性乳腺癌的远处转移和致死率负相关。通过在海绵吸附体内表达 miR-513a-3p,在体外和体内过表达 circNR3C2 会增强 HRD1 的肿瘤抑制作用。该研究阐明了 circNR3C2/miR-513a-3p/HRD1/Vimentin 轴负调节 TNBC 转移,表明 circNR3C2 和 HRD1 可以作为潜在的预后生物标志物,可促进针对侵袭性乳腺癌患者的 circNR3C2 和 HRD1 的治疗剂的开发。



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标题:circEHBP1 通过 miR-130a-3p /TGFβR1/ VEGF- D 信号传导促进膀胱癌的淋巴管生成和淋巴转移

期刊:Mol Ther.

影响因子:8.986

发表时间:2021.02.03

单位:中山大学孙逸仙纪念医院

摘要:淋巴转移是膀胱癌复发和死亡的主要原因。越来越多的证据表明,淋巴管生成是触发淋巴转移所必不可少的。但是,具体机制了解甚少。本研究揭示了一种参与膀胱癌淋巴转移的途径,其中环状 RNA(circRNA)以独立于血管内皮生长因子 C(VEGF-C)的方式促进淋巴管生成。新型 circRNA circEHBP1 在膀胱癌中显著上调,与淋巴结转移和膀胱癌患者预后不良呈正相关。CircEHBP1 通过与 miR-130a-3p 结合并拮抗 miR-130a-3p 对 TGFBR1 的 3'UTR 区的抑制作用,上调了转化生长因子 β 受体 1(TGFBR1)的表达。随后,circEHBP1 介导的 TGFβR1 过表达激活了 TGF-β/ SMAD3 信号通路,从而促进了 VEGF- D 的分泌并驱动膀胱癌的淋巴管生成和淋巴转移。重要的是,体内施用 VEGF- D 中和抗体可显著阻断 circEHBP1 诱导的淋巴管生成和淋巴转移。研究结果表明,circEHBP1/miR-130a-3p /TGFβR1/ VEGF- D 轴有助于膀胱癌的淋巴管生成和淋巴转移,而与 VEGF- C 无关,表明 circEHBP1 可用于膀胱癌淋巴转移的潜在的生物标志物和治疗靶标。



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标题:MSC 诱导的 lncRNA AGAP2-AS1 通过调节乳腺癌中的 CPT1 表达和脂肪酸氧化来促进干性和曲妥珠单抗抗性

期刊:Oncogene

影响因子:7.971

发表时间:2021.01

单位:海南医科大学附属医院

摘要:曲妥珠单抗耐药性已成为治疗 HER- 2 阳性乳腺癌患者的主要障碍,越来越多的证据表明,间充质干细胞(mesenchymal stem cells, MSCs) 在耐药形成过程中发挥重要作用,但其作用机制尚不清楚;研究通过质谱、RNA pull down 和 RNA 免疫沉淀等方法验证 AGAP2-AS 与其他相关靶标(human antigen R (HuR)、miR-15a-5p、carnitine palmitoyl transferase 1 (CPT1)) 之间的直接相互作用。进行体外和体内实验测定以阐明 AGAP2-AS1 在曲妥珠单抗抗性,干性和脂肪酸氧化(FAO)中的功能作用。结果显示间充质干细胞共培养可诱导曲妥珠单抗耐药性。在 msc 培养的细胞中,AGAP2-AS1 表达上调,而 AGAP2-AS1 的下调逆转了 msc 介导的曲妥珠单抗耐药性。MSC 培养诱导的 AGAP2-AS1 通过激活 FAO 调节干性和曲妥珠单抗抗性。从机制上讲,AGAP2-AS1 与 HuR 相关,且 AGAP2-AS1 - HuR 复合物可直接与 CPT1 结合,通过提高 RNA 稳定性增加其表达。此外,AGAP2-AS1 可通过海绵作用 miR- 15a-5p 释放 CPT1 mRNA,发挥 ceRNA 的作用;临床上,血清 AGAP2-AS1 表达升高预示乳腺癌患者对曲妥珠单抗治疗反应不良。综上所述,MSC 培养诱导的 AGAP2-AS1 通过促进 CPT1 表达和诱导 FAO 引起干性和曲妥珠单抗抗性。研究结果为 MSCs 在曲妥珠单抗耐药中的作用提供了新的思路,而 AGAP2-AS1 可能成为 HER-2+ 乳腺癌患者的预测生物标志物和治疗靶点。



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标题:脐带间充质干细胞来源的外泌体 lncRNA H19 通过 miR-29b-3p/FoxO3 轴提高骨软骨活性

期刊:Oncogene

影响因子:7.919

发表时间:2021.01

单位:同济大学医学院附属上海市第十人民医院

摘要:前期研究发现,来自脐带间充质干细胞(UMSCs) 的外泌体 lncRNA H19 在骨软骨再生中发挥着关键作用,在本研究中,研究了外泌体 lncRNA H19 是否可以作为竞争性内源性 RNA (ceRNA) 增强软骨细胞中的骨软骨活性。通过双荧光素酶报告基因检测、RNA pull-down、RNA 免疫沉淀(RIP) 和荧光原位杂交(FISH) 验证 miR-29b-3p 与 lncRNA H19 和靶 mRNA FoxO3 之间的相互作用。软骨细胞用 lncRNA H19 高表达的 umsc 来源的外泌体处理,然后进行凋亡、迁移、衰老和基质分泌评估,通过 SD 大鼠软骨缺损体内模型,探讨 lncRNA H19/miR-29b-3p 的作用及机制。外泌体显示出将 lncRNA H19 转移到软骨细胞的能力,从机制上讲,外泌体 lncRNA H19 作为 miR-29b-3p 竞争的内源性海绵增强了骨软骨活性,而 miR-29b-3p 直接靶向 FoxO3。关节内注射过表达 lncRNA H19 的外泌体可促进持续软骨修复;然而,miR-29b-3p agomir 可能会削弱这一作用。研究揭示了过表达 lncRNA H19 的 umsc 来源的外泌体在制定对抗软骨缺损机制方面的重要作用,研究发现,外泌体 H19 在体内和体外均能促进软骨细胞迁移、基质分泌、凋亡抑制和衰老抑制。其具体机制是外泌体 H19 作为 ceRNA 对抗 miR-29b-3p,上调软骨细胞中的 FoxO3。


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